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   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.
   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.
-====== Current Build Statistics (3.5.180) - January 2020 ======+====== Current Build Statistics (4.4.232) - April 2024 ======
  
  
 ===== Physical and Genetic Interaction Statistics ===== ===== Physical and Genetic Interaction Statistics =====
 ^  Organism ​ ^  Experiment Type  ^  Raw Interactions ​ ^  Non-Redundant Interactions ​ ^  Unique Genes  ^  Unique Publications ​ ^ ^  Organism ​ ^  Experiment Type  ^  Raw Interactions ​ ^  Non-Redundant Interactions ​ ^  Unique Genes  ^  Unique Publications ​ ^
 +|  **//Anas platyrhynchos//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  3  |  3  |  2  |
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  3  |  3  |  2  |
 |  **//​Anopheles gambiae (PEST)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  1  |  2  |  2  | |  **//​Anopheles gambiae (PEST)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  1  |  2  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 15: Line 18:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//​Arabidopsis thaliana (Columbia)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​55,848  ​|  ​48,786  ​|  ​10,500  ​| ​ 2,304  | +|  **//​Arabidopsis thaliana (Columbia)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​82,309  ​|  ​74,004  ​|  ​11,740  ​| ​ 2,364  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​350  ​|  ​282  ​|  ​304  ​|  ​154  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​362  ​|  ​294  ​|  ​322  ​|  ​164  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​56,198  ​|  ​48,981  ​|  ​10,550  ​| ​ 2,384  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​82,671  ​|  ​74,205  ​|  ​11,787  ​| ​ 2,445  |
 |  **//​Bacillus subtilis (168)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  11  |  9  |  4  | |  **//​Bacillus subtilis (168)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  11  |  9  |  4  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  11  |  9  |  4  | |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  11  |  9  |  4  |
-|  **//Bos taurus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​484  ​|  ​436  ​|  ​462  ​|  ​195  |+|  **//Bos taurus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​649  ​|  ​575  ​|  ​595  ​|  ​226  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​484  ​|  ​436  ​|  ​462  ​|  ​195  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​649  ​|  ​575  ​|  ​595  ​|  ​226  | 
-|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​24,514  ​|  ​23,476  ​|  ​6,563  ​|  ​206  | +|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​41,432  ​|  ​37,770  ​|  ​8,668  ​|  ​1,519  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  2,338  ​| ​ 2,271  ​| ​ 1,133  ​|  ​35  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  2,348  ​| ​ 2,281  ​| ​ 1,140  ​|  ​37  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​26,852  ​|  ​25,704  ​|  ​6,942  ​|  ​224  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​43,780  ​|  ​39,997  ​|  ​8,869  ​|  ​1,539  | 
-|  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,548  ​| ​ 1,321  ​|  ​940  ​|  ​168  | +|  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,558  ​| ​ 1,327  ​|  ​948  ​|  ​173  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​527  ​|  ​450  ​|  ​369  ​|  ​35  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​531  ​|  ​454  ​|  ​376  ​|  ​39  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,075  ​| ​ 1,747  ​| ​ 1,199  ​|  ​182  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  2,089  ​| ​ 1,756  ​| ​ 1,210  ​|  ​191  | 
-|  **//Canis familiaris//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​138  ​|  ​126  ​|  ​144  ​|  ​26  |+|  **//Canis familiaris//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​558  ​|  ​540  ​|  ​530  ​|  ​34  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​138  ​|  ​126  ​|  ​144  ​|  ​26  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​558  ​|  ​540  ​|  ​530  ​|  ​34  | 
-|  **//Cavia porcellus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​11  ​|  ​ |+|  **//Cavia porcellus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​10  ​|  ​ ​|  ​14  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​11  ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​10  ​|  ​ ​|  ​14  ​|  ​ |
 |  **//​Chlamydomonas reinhardtii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  17  |  16  |  19  |  4  | |  **//​Chlamydomonas reinhardtii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  17  |  16  |  19  |  4  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  19  |  4  | |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  19  |  4  |
-|  **//​Chlorocebus sabaeus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​17  ​|  ​15  ​|  ​18  ​|  ​ |+|  **//​Chlorocebus sabaeus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​59  ​|  ​53  ​|  ​75  ​|  ​21  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​17  ​|  ​15  ​|  ​18  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​59  ​|  ​53  ​|  ​75  ​|  ​21  | 
-|  **//​Cricetulus griseus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​59  ​|  ​58  ​|  ​71  ​|  ​13  |+|  **//​Cricetulus griseus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​67  ​|  ​64  ​|  ​80  ​|  ​19  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​59  ​|  ​58  ​|  ​71  ​|  ​13  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​67  ​|  ​64  ​|  ​80  ​|  ​19  | 
-|  **//Danio rerio//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​248  ​|  ​210  ​|  ​207  ​|  ​42  |+|  **//Danio rerio//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​506  ​|  ​464  ​|  ​461  ​|  ​50  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  | |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​319  ​|  ​272  ​|  ​263  ​|  ​71  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​577  ​|  ​526  ​|  ​517  ​|  ​79  | 
-|  **//​Dictyostelium discoideum (AX4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​33  ​|  ​20  ​|  ​25  ​|  ​ |+|  **//​Dictyostelium discoideum (AX4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​79  ​|  ​66  ​|  ​72  ​|  ​11  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  8  |  2  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  8  |  2  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​39  ​|  ​23  ​|  ​29  ​|  ​10  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​85  ​|  ​69  ​|  ​76  ​|  ​12  | 
-|  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​62,215  ​|  ​52,407  ​|  ​9,007  ​|  ​3,690  | +|  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​69,520  ​|  ​57,781  ​|  ​10,333  ​|  ​4,368  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​14,476  ​| ​ 10,141  ​| ​ 3,147  ​| ​ 4,395  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​15,348  ​| ​ 10,764  ​| ​ 3,294  ​| ​ 4,640  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​76,691  ​|  ​61,195  ​|  ​9,345  ​|  ​7,159  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​84,868  ​|  ​67,080  ​|  ​10,671  ​|  ​8,040  |
 |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  | |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  71  |  62  |  64  |  6  | |  :::  |  COMBINED ​ |  71  |  62  |  64  |  6  |
-|  **//Equus caballus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//Equus caballus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |
 |  **//​Escherichia coli (K12)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//​Escherichia coli (K12)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//​Escherichia coli (K12/​MC4100/​BW2952)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​10  ​|  ​ |+|  **//​Escherichia coli (K12/​MC4100/​BW2952)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​10  ​|  ​10  ​|  ​12  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​10  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​10  ​|  ​10  ​|  ​12  ​|  ​ | 
-|  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2,304  ​| ​ 2,122  ​| ​ 1,308  ​|  ​29  |+|  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2,290  ​| ​ 2,106  ​| ​ 1,290  ​|  ​37  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  26  |  25  |  36  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  26  |  25  |  36  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,330  ​| ​ 2,146  ​| ​ 1,339  ​|  ​41  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  2,316  ​| ​ 2,130  ​| ​ 1,321  ​|  ​49  | 
-|  **//​Escherichia coli (K12/​W3110)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​12,804  ​|  ​12,801  ​|  ​2,045  ​|  ​ | +|  **//​Escherichia coli (K12/​W3110)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​23,977  ​|  ​23,910  ​|  ​3,440  ​|  ​ | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​171,219  ​|  ​169,594  ​| ​ 3,973  ​|  ​ | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​186,493  ​|  ​184,791  ​| ​ 3,980  ​|  ​ | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​184,023  ​|  ​181,621  ​| ​ 4,063  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​210,470  ​|  ​207,575  ​| ​ 4,174  |  9  | 
-|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​514  ​|  ​437  ​|  ​413  ​|  ​98  |+|  **//Felis Catus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  1  |  2  |  5  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  1  |  2  ​|  ​ | 
 +|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​563  ​|  ​480  ​|  ​454  ​|  ​118  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  | |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​527  ​|  ​446  ​|  ​421  ​|  ​107  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​576  ​|  ​489  ​|  ​462  ​|  ​127  |
 |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
-|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​253  ​|  ​176  ​|  ​178  ​|  ​40  |+|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​613  ​|  ​492  ​|  ​493  ​|  ​57  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​253  ​|  ​176  ​|  ​178  ​|  ​40  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​613  ​|  ​492  ​|  ​493  ​|  ​57  | 
-|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​540,552  ​|  ​403,648  ​|  ​24,221  ​|  ​30,737  | +|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​1,284,388  ​|  ​974,606  ​|  ​28,039  ​|  ​38,200  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​8,981  ​|  ​8,857  ​|  ​3,620  ​|  ​343  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​19,129  ​|  ​18,627  ​|  ​7,480  ​|  ​400  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​549,533  ​|  ​411,816  ​|  ​24,640  ​|  ​30,875  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,303,517  ​|  ​991,487  ​|  ​28,478  ​|  ​38,374  | 
-|  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  ​267  ​|  ​206  ​|  ​174  ​|  ​49  |+|  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  ​326  ​|  ​250  ​|  ​202  ​|  ​71  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​273  ​|  ​211  ​|  ​179  ​|  ​49  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​332  ​|  ​255  ​|  ​207  ​|  ​71  |
 |  **//Human Herpesvirus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  12  |  6  |  10  |  5  | |  **//Human Herpesvirus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  12  |  6  |  10  |  5  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  12  |  6  |  10  |  5  | |  :::  |  COMBINED ​ |  12  |  6  |  10  |  5  |
-|  **//Human Herpesvirus 3//**  |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//Human Herpesvirus 3//**  |  PHYSICAL ​ |  ​16  ​|  ​12  ​|  ​15  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​16  ​|  ​12  ​|  ​15  ​|  ​ | 
-|  **//Human Herpesvirus 4//**  |  PHYSICAL ​ |  ​429  ​|  ​326  ​|  ​323  ​|  ​47  |+|  **//Human Herpesvirus 4//**  |  PHYSICAL ​ |  ​680  ​|  ​544  ​|  ​505  ​|  ​59  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​429  ​|  ​326  ​|  ​323  ​|  ​47  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​680  ​|  ​544  ​|  ​505  ​|  ​59  | 
-|  **//Human Herpesvirus 5//**  |  PHYSICAL ​ |  ​149  ​|  ​108  ​|  ​121  ​|  ​28  |+|  **//Human Herpesvirus 5//**  |  PHYSICAL ​ |  ​202  ​|  ​134  ​|  ​146  ​|  ​41  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​149  ​|  ​108  ​|  ​121  ​|  ​28  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​202  ​|  ​134  ​|  ​146  ​|  ​41  |
 |  **//Human Herpesvirus 6A//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  11  |  8  |  12  |  7  | |  **//Human Herpesvirus 6A//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  11  |  8  |  12  |  7  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 108: Line 114:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Human Herpesvirus 8//**  |  PHYSICAL ​ |  ​779  ​|  ​693  ​|  ​716  ​|  ​42  |+|  **//Human Herpesvirus 8//**  |  PHYSICAL ​ |  ​1,011  ​|  ​901  ​|  ​890  ​|  ​49  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​779  ​|  ​693  ​|  ​716  ​|  ​42  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,011  ​|  ​901  ​|  ​890  ​|  ​49  | 
-|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,046  ​| ​ 1,334  ​| ​ 1,142  ​|  ​357  |+|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,537  ​| ​ 1,738  ​| ​ 1,444  ​|  ​402  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,047  ​| ​ 1,334  ​| ​ 1,142  ​|  ​358  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  2,538  ​| ​ 1,738  ​| ​ 1,444  ​|  ​403  | 
-|  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​89  ​| ​ 80  |  63  |  ​13  |+|  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​91  ​| ​ 80  |  63  |  ​14  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​89  ​| ​ 80  |  63  |  ​13  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​91  ​| ​ 80  |  63  |  ​14  | 
-|  **//Human papillomavirus (10)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//Human papillomavirus (10)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ | 
-|  **//Human papillomavirus (16)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​263  ​|  ​188  ​|  ​175  ​|  ​28  |+|  **//Human papillomavirus (16)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​660  ​|  ​511  ​|  ​484  ​|  ​41  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​263  ​|  ​188  ​|  ​175  ​|  ​28  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​660  ​|  ​511  ​|  ​484  ​|  ​41  | 
-|  **//Human papillomavirus (6b)//**  |  PHYSICAL ​ |  ​20  ​|  ​20  ​|  ​22  ​|  ​ |+|  **//Human papillomavirus (32)//**  |  PHYSICAL ​ |  ​62  ​|  ​58  ​|  ​57  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​20  ​|  ​20  ​|  ​22  ​| ​ 2  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​62  ​|  ​58  ​|  ​57  |  1  | 
 +|  **//Human papillomavirus (5)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  146  |  132  |  128  ​| ​ 2  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  146  |  132  |  128  |  2  | 
 +|  **//Human papillomavirus (6b)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  592  |  581  |  459  |  4  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  592  |  581  |  459  |  4  | 
 +|  **//Human papillomavirus (7)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  **//Human papillomavirus (9)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  96  |  87  |  84  |  1  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  96  |  87  |  84  |  1  |
 |  **//​Leishmania major (Friedlin)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//​Leishmania major (Friedlin)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Macaca mulatta//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​23  ​|  ​14  ​|  ​17  ​|  ​14  |+|  **//Macaca mulatta//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​316  ​|  ​305  ​|  ​310  ​|  ​19  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​23  ​|  ​14  ​|  ​17  ​|  ​14  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​316  ​|  ​305  ​|  ​310  ​|  ​19  |
 |  **//​Meleagris gallopavo//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  **//​Meleagris gallopavo//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//Mus musculus//**  |  PHYSICAL ​ |  ​49,711  ​|  ​43,074  ​|  ​13,​611 ​ |  4,063  | +|  **//Middle-East Respiratory Syndrome-related Coronavirus//**  |  PHYSICAL ​ |  ​1,106  ​|  ​1,051  ​|  ​987  ​|  ​64  |
-|  :::  |  GENETIC ​ |  385  |  340  |  344  |  196  | +
-|  :::  |  COMBINED ​ |  50,​096 ​ |  43,​339 ​ |  13,​669 ​ |  4,201  | +
-|  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  15  |  12  |  15  ​|  ​ |+
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​15  ​|  ​12  ​|  ​15  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,106  ​|  ​1,051  ​|  ​987  ​|  ​64  | 
-|  **//​Neurospora crassa (OR74A)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​11  ​|  ​10  ​|  ​12  ​|  ​ |+|  **//​Monodelphis domestica//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  4  |  2  |  3  |  1  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  4  |  2  |  3  |  1  | 
 +|  **//Murid Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  100,​231 ​ |  91,​566 ​ |  18,​148 ​ |  4,704  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  938  |  890  |  833  |  209  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  101,​169 ​ |  92,​371 ​ |  18,​286 ​ |  4,852  | 
 +|  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  24  |  20  |  25  |  7  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  24  |  20  |  25  |  7  | 
 +|  **//Myotis lucifugus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  **//​Neurospora crassa (OR74A)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​33  ​|  ​32  ​|  ​35  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​11  ​|  ​10  ​|  ​12  ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​33  ​|  ​32  ​|  ​35  ​|  ​ |
 |  **//​Nicotiana tomentosiformis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  2  |  1  | |  **//​Nicotiana tomentosiformis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//​Oryctolagus cuniculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​318  ​|  ​284  ​|  ​293  ​|  ​66  |+|  **//​Oryctolagus cuniculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​385  ​|  ​340  ​|  ​350  ​|  ​74  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​318  ​|  ​284  ​|  ​293  ​|  ​66  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​385  ​|  ​340  ​|  ​350  ​|  ​74  | 
-|  **//Oryza sativa (Japonica)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​346  ​|  ​330  ​|  ​314  ​|  ​21  |+|  **//Oryza sativa (Japonica)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​364  ​|  ​344  ​|  ​328  ​|  ​23  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​348  ​|  ​332  ​|  ​314  ​|  ​21  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​366  ​|  ​346  ​|  ​328  ​|  ​23  |
 |  **//Ovis aries//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//Ovis aries//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Pan troglodytes//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​10  ​|  ​ |+|  **//Pan troglodytes//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​49  ​|  ​48  ​|  ​54  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​10  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​49  ​|  ​48  ​|  ​54  ​|  ​ | 
-|  **//​Pediculus humanus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//​Pediculus humanus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ | 
-|  **//​Plasmodium falciparum (3D7)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2,545  ​| ​ 2,508  ​| ​ 1,227  ​|  ​ |+|  **//​Plasmodium falciparum (3D7)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2,552  ​| ​ 2,511  ​| ​ 1,232  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  ​| ​ 2,508  ​| ​ 1,227  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  2,552  ​| ​ 2,511  ​| ​ 1,232  ​|  ​ | 
-|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​7,917  ​|  ​6,736  ​|  ​4,197  ​| ​ 1,178  |+|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​10,583  ​|  ​9,174  ​|  ​5,084  ​| ​ 1,392  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​7,936  ​|  ​6,746  ​|  ​4,207  ​| ​ 1,181  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​10,602  ​|  ​9,184  ​|  ​5,094  ​| ​ 1,395  |
 |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
-|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​174,169  ​|  ​116,144  ​| ​ 7,072  ​|  ​9,550  | +|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​254,076  ​|  ​173,319  ​| ​ 7,189  ​|  ​10,806  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​577,782  ​|  ​442,060  ​| ​ 5,960  ​|  ​9,259  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​596,412  ​|  ​455,355  ​| ​ 5,979  ​|  ​10,403  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​751,951  ​|  ​544,619  ​| ​ 7,326  ​|  ​15,799  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​850,488  ​|  ​610,445  ​| ​ 7,406  ​|  ​17,754  | 
-|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​17,226  ​|  ​12,913  ​| ​ 3,566  ​| ​ 1,601  | +|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​19,753  ​|  ​14,967  ​| ​ 3,856  ​| ​ 1,722  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​61,734  ​| ​ 52,014  ​| ​ 3,565  ​|  ​1,959  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​62,829  ​| ​ 52,859  ​| ​ 3,653  ​|  ​2,075  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​78,960  ​|  ​63,807  ​| ​ 4,627  ​|  ​2,818  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​82,582  ​|  ​66,627  ​| ​ 4,759  ​|  ​3,023  |
 |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  | |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  10  |  8  |  6  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  10  |  8  |  6  |  1  |
-|  **//Simian Immunodeficiency Virus//**  |  PHYSICAL ​ |  ​34  ​|  ​16  ​|  ​19  ​|  ​16  |+|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus//**  |  PHYSICAL ​ |  ​2,451  ​|  ​1,934  ​|  ​1,547  ​|  ​287  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​34  ​|  ​16  ​|  ​19  ​|  ​16  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​2,451  ​|  ​1,934  ​|  ​1,547  ​|  ​287  | 
-|  **//Simian Virus 40//**  |  PHYSICAL ​ |  ​11  ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​40,​664 ​ ​|  ​27,​129 ​ ​|  ​7,039  ​|  ​1,269  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​11  ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​40,​664 ​ ​|  ​27,​129 ​ ​|  ​7,039  ​|  ​1,269  | 
 +|  **//Simian Immunodeficiency Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  37  |  18  |  21  |  18  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  37  |  18  |  21  |  18  | 
 +|  **//Simian Virus 40//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  8  |  9  |  13  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  8  |  9  |  13  |
 |  **//Solanum lycopersicum//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  137  |  107  |  44  |  8  | |  **//Solanum lycopersicum//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  137  |  107  |  44  |  8  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  4  |  4  |  4  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  4  |  4  |  4  |  1  |
Line 192: Line 228:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  3  |  5  |  3  | |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  3  |  5  |  3  |
 +|  **//Sorghum bicolor//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  **//​Streptococcus pneumoniae (ATCCBAA255)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  16  |  9  |  6  |  1  | |  **//​Streptococcus pneumoniae (ATCCBAA255)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  16  |  9  |  6  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 198: Line 237:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  17  |  3  | |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  17  |  3  |
-|  **//Sus scrofa//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​90  ​|  ​84  ​|  ​102  ​|  ​32  |+|  **//Sus scrofa//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​116  ​|  ​104  ​|  ​125  ​|  ​45  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​90  ​|  ​84  ​|  ​102  ​|  ​32  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​116  ​|  ​104  ​|  ​125  ​|  ​45  |
 |  **//Tobacco Mosaic Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  3  |  1  | |  **//Tobacco Mosaic Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  3  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 207: Line 246:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  4  |  4  |  4  |  4  | |  :::  |  COMBINED ​ |  4  |  4  |  4  |  4  |
-|  **//​Vaccinia Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//​Vaccinia Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​18  ​|  ​10  ​|  ​13  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​18  ​|  ​10  ​|  ​13  ​|  ​ |
 |  **//Vitis vinifera//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//Vitis vinifera//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​1,412  ​|  ​1,248  ​| ​ 1,144  ​|  ​231  |+|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​2,452  ​|  ​2,057  ​| ​ 1,580  ​|  ​272  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,419  ​|  ​1,255  ​| ​ 1,154  ​|  ​234  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​2,459  ​|  ​2,064  ​| ​ 1,589  ​|  ​275  |
 |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
-|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​925,793  ​|  ​701,957  ​|  ​72,555  ​|  ​50,048  | +|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​1,862,​288 ​ ​|  ​1,433,064  ​|  ​85,509  ​|  ​61,501  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​837,401  ​|  ​685,634  ​|  ​21,985  ​|  ​16,263  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​883,948  ​|  ​725,892  ​|  ​26,588  ​|  ​17,840  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,763,194  ​|  ​1,369,855  ​|  ​77,087  ​|  ​61,223  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​2,746,236  ​|  ​2,134,950  ​|  ​88,455  ​|  ​73,702  |
  
 ===== Chemical Interaction Statistics ===== ===== Chemical Interaction Statistics =====
Line 230: Line 269:
 |  **//​Escherichia coli (K12)//​** ​ |  5  |  2  |  2  |  3  |  2  | |  **//​Escherichia coli (K12)//​** ​ |  5  |  2  |  2  |  3  |  2  |
 |  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  1,590  |  834  |  287  |  137  |  583  | |  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  1,590  |  834  |  287  |  137  |  583  |
-|  **//Homo sapiens//​** ​ |  ​25,841  ​|  ​10,854  ​| ​ 2,183  ​|  ​8,944  ​|  ​4,593  |+|  **//Homo sapiens//​** ​ |  ​28,619  ​|  ​12,296  ​| ​ 2,294  ​|  ​9,543  ​|  ​5,854  |
 |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  65  |  24  |  3  |  24  |  21  | |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  65  |  24  |  3  |  24  |  21  |
 |  **//Human Herpesvirus 4//**  |  10  |  3  |  3  |  6  |  3  | |  **//Human Herpesvirus 4//**  |  10  |  3  |  3  |  6  |  3  |
 |  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  105  |  53  |  2  |  48  |  53  | |  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  105  |  53  |  2  |  48  |  53  |
 |  **//​Leishmania major (Friedlin)//​** ​ |  8  |  4  |  1  |  2  |  4  | |  **//​Leishmania major (Friedlin)//​** ​ |  8  |  4  |  1  |  2  |  4  |
 +|  **//​Middle-East Respiratory Syndrome-related Coronavirus//​** ​ |  18  |  18  |  5  |  12  |  18  |
 |  **//Mus musculus//​** ​ |  2  |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//Mus musculus//​** ​ |  2  |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  **//​Mycobacterium tuberculosis (CDC1551)//​** ​ |  3  |  3  |  3  |  1  |  3  | |  **//​Mycobacterium tuberculosis (CDC1551)//​** ​ |  3  |  3  |  3  |  1  |  3  |
Line 242: Line 282:
 |  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  2  |  2  |  1  |  2  |  2  | |  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  2  |  2  |  1  |  2  |  2  |
 |  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  7  |  7  |  2  |  2  |  7  | |  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  7  |  7  |  2  |  2  |  7  |
 +|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus//​** ​ |  30  |  30  |  7  |  22  |  29  |
 +|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2//**  |  225  |  214  |  12  |  125  |  198  |
 |  **//​Streptococcus pneumoniae (ATCCBAA255)//​** ​ |  82  |  72  |  8  |  11  |  29  | |  **//​Streptococcus pneumoniae (ATCCBAA255)//​** ​ |  82  |  72  |  8  |  11  |  29  |
 |  **//​Streptococcus pneumoniae (ATCCBAA334)//​** ​ |  61  |  26  |  10  |  18  |  19  | |  **//​Streptococcus pneumoniae (ATCCBAA334)//​** ​ |  61  |  26  |  10  |  18  |  19  |
 |  **//​Synechococcus elongatus (PCC6301)//​** ​ |  4  |  2  |  1  |  2  |  2  | |  **//​Synechococcus elongatus (PCC6301)//​** ​ |  4  |  2  |  1  |  2  |  2  |
 |  **//​Vaccinia Virus//​** ​ |  21  |  11  |  2  |  3  |  11  | |  **//​Vaccinia Virus//​** ​ |  21  |  11  |  2  |  3  |  11  |
-|  **//All Organisms//​** ​ |  ​28,093  ​|  ​12,015  ​| ​ 2,572  ​| ​ 9,219  ​|  ​5,173  |+|  **//All Organisms//​** ​ |  ​31,144  ​|  ​13,719  ​| ​ 2,707  ​| ​ 9,952  ​|  ​6,597  |
  
 ===== Post Translational Modification (PTM) Statistics ===== ===== Post Translational Modification (PTM) Statistics =====
Line 267: Line 309:
 |  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  1  | |  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  1  |
 |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  | |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  |
-|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 7  |  ​ ​|  ​ ​|  ​ | +|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​3,534  ​|  ​3,534  ​| ​ 7  |  ​3,343  ​|  ​1,045  ​|  ​ | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 11  |  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​3,534  ​|  ​3,534  ​| ​ 11  |  ​3,343  ​|  ​1,047  ​|  ​ |
 |  **//Gallus gallus//​** ​ |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  | |  **//Gallus gallus//​** ​ |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  |
 |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  | |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  |
Line 277: Line 319:
 |  :::  |  FAT10YLATION ​ |  0  |  0  |  696  |  0  |  659  |  5  | |  :::  |  FAT10YLATION ​ |  0  |  0  |  696  |  0  |  659  |  5  |
 |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  28  |  0  |  28  |  7  | |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  28  |  0  |  28  |  7  |
-|  :::  |  NEDDYLATION ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 1,093  |  0  |  ​903  ​|  ​75  |+|  :::  |  NEDDYLATION ​ |  ​2,835  ​|  ​2,835  ​| ​ 1,093  ​| ​ 1,605  |  1,282  |  76  | 
 +|  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  49,​613 ​ |  45,​405 ​ ​| ​ 0  |  ​14,​434 ​ |  4,597  ​|  ​ |
 |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  4,392  |  0  |  2,317  |  330  | |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  4,392  |  0  |  2,317  |  330  |
-|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​705,673  ​|  ​383,699  ​| ​ 39,​038 ​ |  ​54,962  ​|  ​11,895  ​| ​ 3,118  | +|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​901,514  ​|  ​436,834  ​| ​ 39,​038 ​ |  ​62,095  ​|  ​12,523  ​| ​ 3,125  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​705,673  ​|  ​383,699  ​| ​ 45,​249 ​ |  ​54,962  ​|  ​12,022  ​| ​ 3,408  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​953,962  ​|  ​485,074  ​| ​ 45,​249 ​ |  ​63,685  ​|  ​13,034  ​| ​ 3,417  |
 |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  | |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  |
 |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  3  |  4  | |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  3  |  4  |
Line 299: Line 342:
 |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  43  |  0  |  42  |  2  | |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  43  |  0  |  42  |  2  |
 |  :::  |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  7  |  0  |  6  |  5  | |  :::  |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  7  |  0  |  6  |  5  |
-|  :::  |  SUMOYLATION ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 49  |  ​ ​|  ​41  ​|  ​39  |+|  :::  |  SUMOYLATION ​ |  ​222  ​|  ​222  ​| ​ 49  |  ​173  ​|  ​208  ​|  ​40  |
 |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  34,​482 ​ |  34,​482 ​ |  737  |  13,​810 ​ |  3,872  |  444  | |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  34,​482 ​ |  34,​482 ​ |  737  |  13,​810 ​ |  3,872  |  444  |
 |  :::  |  UFMYLATION ​ |  0  |  0  |  10  |  0  |  10  |  1  | |  :::  |  UFMYLATION ​ |  0  |  0  |  10  |  0  |  10  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  34,482  ​| ​ 34,482  ​| ​ 847  |  13,810  ​|  ​3,901  ​|  ​484  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  34,704  ​| ​ 34,704  ​| ​ 847  |  13,929  ​|  ​4,009  ​|  ​485  |
 |  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  | |  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  |
 |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  6  |  0  |  6  |  6  | |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  6  |  0  |  6  |  6  |
Line 310: Line 353:
 |  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  42,​907 ​ |  19,​981 ​ |  0  |  3,165  |  3,165  |  528  | |  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  42,​907 ​ |  19,​981 ​ |  0  |  3,165  |  3,165  |  528  |
 |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1,438  |  0  |  818  |  67  | |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1,438  |  0  |  818  |  67  |
-|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​34,338  ​| ​ 20,019  ​| ​ 9,736  |  2,549  ​| ​ 3,678  ​|  ​215  | +|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​35,651  ​| ​ 20,308  ​| ​ 9,736  |  2,574  ​| ​ 3,686  ​|  ​216  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​77,245  ​| ​ 40,000  ​| ​ 11,​184 ​ |  3,918  ​| ​ 4,499  ​|  ​802  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​78,558  ​| ​ 40,289  ​| ​ 11,​184 ​ |  3,928  ​| ​ 4,501  ​|  ​803  |
 |  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  4  |  3  | |  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  4  |  3  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  4  |  3  | |  :::  |  COMBINED ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  4  |  3  |
 +|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2//**  |  PHOSPHORYLATION ​ |  79  |  50  |  0  |  6  |  4  |  3  |
 +|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  106  |  106  |  0  |  20  |  9  |  1  |
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  185  |  156  |  0  |  20  |  9  |  4  |
 |  **//Xenopus laevis//​** ​ |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  | |  **//Xenopus laevis//​** ​ |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  |
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 |  :::  |  FAT10YLATION ​ |  0  |  0  |  696  |  0  |  659  |  5  | |  :::  |  FAT10YLATION ​ |  0  |  0  |  696  |  0  |  659  |  5  |
 |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  71  |  0  |  70  |  8  | |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  71  |  0  |  70  |  8  |
-|  :::  |  NEDDYLATION ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 1,113  |  ​ ​|  ​916  ​|  ​84  | +|  :::  |  NEDDYLATION ​ |  ​2,835  ​|  ​2,835  ​| ​ 1,113  |  ​1,605  ​|  ​1,295  ​|  ​85  | 
-|  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  ​42,907  ​|  ​19,981  ​| ​ 0  |  ​3,165  ​|  ​3,165  ​|  ​528  | +|  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  ​92,599  ​|  ​65,436  ​| ​ 0  |  ​17,605  ​|  ​7,766  ​|  ​532  | 
-|  :::  |  SUMOYLATION ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 5,898  |  ​ ​| ​ 3,195  ​|  ​433  | +|  :::  |  SUMOYLATION ​ |  ​222  ​|  ​222  ​| ​ 5,898  |  ​173  ​| ​ 3,362  ​|  ​434  | 
-|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​774,493  ​|  ​438,200  ​| ​ 49,​605 ​ |  ​71,321  ​|  ​19,522  ​| ​ 3,741  |+|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​975,287  ​|  ​495,264  ​| ​ 49,​605 ​ |  ​81,842  ​|  ​21,205  ​| ​ 3,750  |
 |  :::  |  UFMYLATION ​ |  0  |  0  |  10  |  0  |  10  |  1  | |  :::  |  UFMYLATION ​ |  0  |  0  |  10  |  0  |  10  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​817,400  ​|  ​458,181  ​| ​ 57,​396 ​ |  ​72,690  ​|  ​20,513  ​| ​ 4,643  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,070,​943 ​ ​|  ​563,757  ​| ​ 57,​396 ​ |  ​84,905  ​|  ​22,682  ​| ​ 4,656  |
  
  
 **Note:** Individual organism counts listed above may total to more than the values in ALL Organisms due to some interactions being counted multiple times due to cross species interactions. **Note:** Individual organism counts listed above may total to more than the values in ALL Organisms due to some interactions being counted multiple times due to cross species interactions.
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