Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
Next revision Both sides next revision
statistics [2020/03/01 00:03]
biogridadmin
statistics [2020/04/14 00:11]
biogridadmin
Line 4: Line 4:
   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.
   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.
-====== Current Build Statistics (3.5.182) - March 2020 ======+====== Current Build Statistics (3.5.184) - April 15th 2020 ======
  
  
Line 21: Line 21:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  11  |  9  |  4  | |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  11  |  9  |  4  |
-|  **//Bos taurus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​495  ​|  ​443  ​|  ​467  ​|  ​199  |+|  **//Bos taurus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​589  ​|  ​528  ​|  ​549  ​|  ​202  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​495  ​|  ​443  ​|  ​467  ​|  ​199  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​589  ​|  ​528  ​|  ​549  ​|  ​202  |
 |  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  20,​124 ​ |  19,​477 ​ |  5,405  |  205  | |  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  20,​124 ​ |  19,​477 ​ |  5,405  |  205  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2,338  |  2,271  |  1,133  |  35  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2,338  |  2,271  |  1,133  |  35  |
Line 39: Line 39:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  19  |  4  | |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  19  |  4  |
-|  **//​Chlorocebus sabaeus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​18  ​|  ​16  ​|  ​20  ​|  ​ |+|  **//​Chlorocebus sabaeus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​19  ​|  ​17  ​|  ​21  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​18  ​|  ​16  ​|  ​20  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​19  ​|  ​17  ​|  ​21  ​|  ​ | 
-|  **//​Cricetulus griseus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​59  ​|  ​58  ​|  ​71  ​|  ​13  |+|  **//​Cricetulus griseus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​60  ​|  ​59  ​|  ​73  ​|  ​14  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​59  ​|  ​58  ​|  ​71  ​|  ​13  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​60  ​|  ​59  ​|  ​73  ​|  ​14  |
 |  **//Danio rerio//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  248  |  210  |  207  |  42  | |  **//Danio rerio//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  248  |  210  |  207  |  42  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  | |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  |
Line 51: Line 51:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  8  |  2  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  8  |  2  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  39  |  23  |  29  |  10  | |  :::  |  COMBINED ​ |  39  |  23  |  29  |  10  |
-|  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  62,219  ​| ​ 52,411  ​| ​ 9,011  ​| ​ 3,694  |+|  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  62,220  ​| ​ 52,412  ​| ​ 9,012  ​| ​ 3,695  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  14,​476 ​ |  10,​141 ​ |  3,147  |  4,395  | |  :::  |  GENETIC ​ |  14,​476 ​ |  10,​141 ​ |  3,147  |  4,395  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  76,695  ​| ​ 61,199  ​| ​ 9,348  ​| ​ 7,163  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  76,696  ​| ​ 61,200  ​| ​ 9,349  ​| ​ 7,164  |
 |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  | |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  |
Line 72: Line 72:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  | |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  184,​023 ​ |  181,​621 ​ |  4,063  |  7  | |  :::  |  COMBINED ​ |  184,​023 ​ |  181,​621 ​ |  4,063  |  7  |
-|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​514  ​|  ​437  ​|  ​413  ​|  ​98  |+|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​515  ​|  ​438  ​|  ​414  ​|  ​99  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  | |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​527  ​|  ​446  ​|  ​421  ​|  ​107  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​528  ​|  ​447  ​|  ​422  ​|  ​108  |
 |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 81: Line 81:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  254  |  177  |  179  |  41  | |  :::  |  COMBINED ​ |  254  |  177  |  179  |  41  |
-|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​552,343  ​|  ​413,295  ​| ​ 24,310  ​| ​ 31,067  | +|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​563,137  ​|  ​422,880  ​| ​ 24,761  ​| ​ 31,271  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  9,102  ​| ​ 8,978  ​| ​ 3,721  ​|  ​345  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  9,121  ​| ​ 8,995  ​| ​ 3,731  ​|  ​348  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​561,445  ​|  ​421,578  ​|  ​24,750  ​| ​ 31,206  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​572,258  ​|  ​431,177  ​|  ​25,208  ​| ​ 31,410  | 
-|  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  ​267  ​|  ​206  ​| ​ 174  |  ​49  |+|  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  ​269  ​|  ​208  ​| ​ 174  |  ​50  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​273  ​|  ​211  ​| ​ 179  |  ​49  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​275  ​|  ​213  ​| ​ 179  |  ​50  |
 |  **//Human Herpesvirus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  12  |  6  |  10  |  5  | |  **//Human Herpesvirus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  12  |  6  |  10  |  5  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 111: Line 111:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  779  |  693  |  716  |  42  | |  :::  |  COMBINED ​ |  779  |  693  |  716  |  42  |
-|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,054  ​| ​ 1,336  ​| ​ 1,144  ​|  ​360  |+|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,058  ​| ​ 1,338  ​| ​ 1,146  ​|  ​362  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,055  ​| ​ 1,336  ​| ​ 1,144  ​|  ​361  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  2,059  ​| ​ 1,338  ​| ​ 1,146  ​|  ​363  |
 |  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  89  |  80  |  63  |  13  | |  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  89  |  80  |  63  |  13  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 135: Line 135:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​50,712  ​|  ​44,006  ​| ​ 13,737  ​| ​ 4,102  |+|  **//​Middle-East Respiratory Syndrome-related Coronavirus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  3  |  6  |  3  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  3  |  6  |  3  | 
 +|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​51,942  ​|  ​45,210  ​| ​ 13,973  ​| ​ 4,129  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  388  |  343  |  348  |  197  | |  :::  |  GENETIC ​ |  388  |  343  |  348  |  197  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​51,100  ​|  ​44,274  ​|  ​13,798  ​| ​ 4,240  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​52,330  ​|  ​45,478  ​|  ​14,033  ​| ​ 4,267  |
 |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  15  |  12  |  15  |  5  | |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  15  |  12  |  15  |  5  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 165: Line 168:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  |
-|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8,014  ​| ​ 6,811  ​| ​ 4,224  ​| ​ 1,208  |+|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8,129  ​| ​ 6,898  ​| ​ 4,245  ​| ​ 1,221  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  8,033  ​| ​ 6,821  ​| ​ 4,234  ​| ​ 1,211  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  8,148  ​| ​ 6,908  ​| ​ 4,255  ​| ​ 1,224  |
 |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
-|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  174,264  ​| ​ 116,153  ​| ​ 7,072  ​| ​ 9,566  | +|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  174,388  ​| ​ 116,185  ​| ​ 7,074  ​| ​ 9,608  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​577,849  ​| ​ 442,085  ​| ​ 5,961  ​| ​ 9,272  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​578,066  ​| ​ 442,212  ​| ​ 5,962  ​| ​ 9,308  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  752,113  ​| ​ 544,644  ​| ​ 7,327  ​| ​ 15,825  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  752,454  ​| ​ 544,788  ​| ​ 7,329  ​| ​ 15,889  |
 |  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  17,​226 ​ |  12,​913 ​ |  3,566  |  1,601  | |  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  17,​226 ​ |  12,​913 ​ |  3,566  |  1,601  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  61,​734 ​ |  52,​014 ​ |  3,565  |  1,959  | |  :::  |  GENETIC ​ |  61,​734 ​ |  52,​014 ​ |  3,565  |  1,959  |
Line 180: Line 183:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  10  |  8  |  6  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  10  |  8  |  6  |  1  |
 +|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  112  |  98  |  100  |  15  |
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  112  |  98  |  100  |  15  |
 +|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  363  |  339  |  361  |  16  |
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  363  |  339  |  361  |  16  |
 |  **//Simian Immunodeficiency Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  34  |  16  |  19  |  16  | |  **//Simian Immunodeficiency Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  34  |  16  |  19  |  16  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 198: Line 207:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  17  |  3  | |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  17  |  3  |
-|  **//Sus scrofa//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​93  ​|  ​87  ​|  ​104  ​|  ​34  |+|  **//Sus scrofa//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​94  ​|  ​88  ​|  ​106  ​|  ​35  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​93  ​|  ​87  ​|  ​104  ​|  ​34  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​94  ​|  ​88  ​|  ​106  ​|  ​35  |
 |  **//Tobacco Mosaic Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  3  |  1  | |  **//Tobacco Mosaic Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  3  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 213: Line 222:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,412  ​| ​ 1,248  ​| ​ 1,144  ​|  ​231  |+|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,421  ​| ​ 1,256  ​| ​ 1,152  ​|  ​233  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,419  ​| ​ 1,255  ​| ​ 1,154  ​|  ​234  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,428  ​| ​ 1,263  ​| ​ 1,162  ​|  ​236  |
 |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
-|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​934,096  ​|  ​708,334  ​| ​ 71,565  ​| ​ 50,410  | +|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​945,837  ​|  ​718,711  ​| ​ 71,957  ​| ​ 50,672  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  837,589  ​| ​ 685,780  ​| ​ 22,087  ​| ​ 16,278  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  837,808  ​| ​ 685,909  ​| ​ 22,088  ​| ​ 16,315  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,771,685  ​| ​ 1,376,369  ​| ​ 76,191  ​| ​ 61,595  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,783,645  ​| ​ 1,386,858  ​| ​ 76,581  ​| ​ 61,878  |
  
 ===== Chemical Interaction Statistics ===== ===== Chemical Interaction Statistics =====
Line 330: Line 339:
 ====== Previous Build Statistics ====== ====== Previous Build Statistics ======
 ==== 2020 Updates ====  ==== 2020 Updates ==== 
 +  * **[[Build 3.5.184]]**
 +  * **[[Build 3.5.183]]**
   * **[[Build 3.5.182]]**   * **[[Build 3.5.182]]**
   * **[[Build 3.5.181]]**   * **[[Build 3.5.181]]**
 
statistics.txt · Last modified: 2024/04/01 00:50 by biogridadmin