Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
Next revision Both sides next revision
statistics [2019/06/28 02:30]
biogridadmin
statistics [2019/10/01 01:43]
biogridadmin
Line 4: Line 4:
   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.
   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.
-====== Current Build Statistics (3.5.174) - July 2019 ====== +====== Current Build Statistics (3.5.177) - October ​2019 ======
- +
  
 ===== Physical and Genetic Interaction Statistics ===== ===== Physical and Genetic Interaction Statistics =====
Line 16: Line 14:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//​Arabidopsis thaliana (Columbia)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  55,613  ​| ​ 48,572  ​| ​ 10,417  ​| ​ 2,298  |+|  **//​Arabidopsis thaliana (Columbia)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  55,621  ​| ​ 48,577  ​| ​ 10,418  ​| ​ 2,299  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  350  |  282  |  304  |  154  | |  :::  |  GENETIC ​ |  350  |  282  |  304  |  154  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  55,963  ​| ​ 48,767  ​| ​ 10,467  ​| ​ 2,378  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  55,971  ​| ​ 48,772  ​| ​ 10,468  ​| ​ 2,379  |
 |  **//​Bacillus subtilis (168)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  3  |  2  | |  **//​Bacillus subtilis (168)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  3  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  3  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  3  |  2  |
-|  **//Bos taurus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​479  ​|  ​431  ​|  ​455  ​|  ​191  |+|  **//Bos taurus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​481  ​|  ​433  ​|  ​457  ​|  ​193  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​479  ​|  ​431  ​|  ​455  ​|  ​191  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​481  ​|  ​433  ​|  ​457  ​|  ​193  | 
-|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​6,364  ​|  ​5,811  ​|  ​3,282  ​|  ​198  |+|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​22,232  ​|  ​21,583  ​|  ​5,980  ​|  ​202  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2,338  |  2,271  |  1,133  |  35  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2,338  |  2,271  |  1,133  |  35  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​8,702  ​|  ​8,057  ​|  ​3,955  ​|  ​216  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​24,570  ​|  ​23,813  ​|  ​6,404  ​|  ​220  | 
-|  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,080  ​|  ​876  ​|  ​705  ​|  ​152  | +|  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,450  ​|  ​1,226  ​|  ​876  ​|  ​166  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​521  ​|  ​444  ​|  ​363  ​|  ​32  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​527  ​|  ​450  ​|  ​369  ​|  ​35  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,601  ​| ​ 1,304  ​|  ​975  ​|  ​166  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,977  ​| ​ 1,652  ​|  ​1,139  ​|  ​180  |
 |  **//Canis familiaris//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  138  |  126  |  144  |  26  | |  **//Canis familiaris//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  138  |  126  |  144  |  26  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 43: Line 41:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  15  |  18  |  6  | |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  15  |  18  |  6  |
-|  **//​Cricetulus griseus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​55  ​|  ​55  ​|  ​65  ​|  ​10  |+|  **//​Cricetulus griseus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​58  ​|  ​57  ​|  ​69  ​|  ​12  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​55  ​|  ​55  ​|  ​65  ​|  ​10  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​58  ​|  ​57  ​|  ​69  ​|  ​12  |
 |  **//Danio rerio//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  248  |  210  |  207  |  42  | |  **//Danio rerio//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  248  |  210  |  207  |  42  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  | |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  |
Line 52: Line 50:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  8  |  2  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  8  |  2  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  38  |  22  |  27  |  9  | |  :::  |  COMBINED ​ |  38  |  22  |  27  |  9  |
-|  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  62,204  ​| ​ 52,402  ​| ​ 9,002  ​| ​ 3,684  |+|  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  62,209  ​| ​ 52,404  ​| ​ 9,003  ​| ​ 3,686  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  14,​475 ​ |  10,​140 ​ |  3,146  |  4,394  | |  :::  |  GENETIC ​ |  14,​475 ​ |  10,​140 ​ |  3,146  |  4,394  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  76,679  ​| ​ 61,190  ​| ​ 9,339  ​| ​ 7,153  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  76,684  ​| ​ 61,191  ​| ​ 9,340  ​| ​ 7,154  |
 |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  | |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  |
Line 67: Line 65:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  9  |  9  |  10  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  9  |  9  |  10  |  2  |
-|  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2,299  ​| ​ 2,117  ​| ​ 1,303  ​|  ​26  |+|  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2,301  ​| ​ 2,119  ​| ​ 1,305  ​|  ​28  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  26  |  25  |  36  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  26  |  25  |  36  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,325  ​| ​ 2,141  ​| ​ 1,334  ​|  ​38  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  2,327  ​| ​ 2,143  ​| ​ 1,336  ​|  ​40  |
 |  **//​Escherichia coli (K12/​W3110)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12,​804 ​ |  12,​801 ​ |  2,045  |  3  | |  **//​Escherichia coli (K12/​W3110)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12,​804 ​ |  12,​801 ​ |  2,045  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  | |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  184,​023 ​ |  181,​621 ​ |  4,063  |  7  | |  :::  |  COMBINED ​ |  184,​023 ​ |  181,​621 ​ |  4,063  |  7  |
-|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​508  ​|  ​431  ​|  ​404  ​|  ​93  |+|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​510  ​|  ​433  ​|  ​408  ​|  ​95  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  | |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​521  ​|  ​440  ​|  ​412  ​|  ​102  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​523  ​|  ​442  ​|  ​416  ​|  ​104  |
 |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
-|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​200  ​|  ​133  ​|  ​135  ​|  ​35  |+|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​207  ​|  ​135  ​|  ​137  ​|  ​37  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​200  ​|  ​133  ​|  ​135  ​|  ​35  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​207  ​|  ​135  ​|  ​137  ​|  ​37  | 
-|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​512,912  ​|  ​381,958  ​|  ​23,929  ​|  ​29,695  | +|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​523,461  ​|  ​389,300  ​|  ​24,024  ​|  ​30,257  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  7,807  ​| ​ 7,715  ​| ​ 2,677  ​|  ​334  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  7,808  ​| ​ 7,716  ​| ​ 2,678  ​|  ​335  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​520,719  ​|  ​389,038  ​| ​ 24,280  ​|  ​29,828  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​531,269  ​|  ​396,364  ​| ​ 24,373  ​|  ​30,390  |
 |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  265  |  204  |  173  |  48  | |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  265  |  204  |  173  |  48  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  271  |  209  |  178  |  48  | |  :::  |  COMBINED ​ |  271  |  209  |  178  |  48  |
-|  **//Human Herpesvirus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//Human Herpesvirus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​12  ​|  ​ ​|  ​10  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​12  ​|  ​ ​|  ​10  ​|  ​ |
 |  **//Human Herpesvirus 3//**  |  PHYSICAL ​ |  5  |  3  |  6  |  3  | |  **//Human Herpesvirus 3//**  |  PHYSICAL ​ |  5  |  3  |  6  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  3  |  6  |  3  | |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  3  |  6  |  3  |
-|  **//Human Herpesvirus 4//**  |  PHYSICAL ​ |  ​408  ​|  ​308  ​|  ​307  ​|  ​46  |+|  **//Human Herpesvirus 4//**  |  PHYSICAL ​ |  ​429  ​|  ​326  ​|  ​323  ​|  ​47  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​408  ​|  ​308  ​|  ​307  ​|  ​46  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​429  ​|  ​326  ​|  ​323  ​|  ​47  | 
-|  **//Human Herpesvirus 5//**  |  PHYSICAL ​ |  ​119  ​|  ​82  ​|  ​94  ​|  ​26  |+|  **//Human Herpesvirus 5//**  |  PHYSICAL ​ |  ​149  ​|  ​108  ​|  ​121  ​|  ​28  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​119  ​|  ​82  ​|  ​94  ​|  ​26  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​149  ​|  ​108  ​|  ​121  ​|  ​28  |
 |  **//Human Herpesvirus 6A//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  11  |  8  |  12  |  7  | |  **//Human Herpesvirus 6A//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  11  |  8  |  12  |  7  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 109: Line 107:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Human Herpesvirus 8//**  |  PHYSICAL ​ |  ​777  ​|  ​692  ​|  ​715  ​|  ​41  |+|  **//Human Herpesvirus 8//**  |  PHYSICAL ​ |  ​779  ​|  ​693  ​|  ​716  ​|  ​42  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​777  ​|  ​692  ​|  ​715  ​|  ​41  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​779  ​|  ​693  ​|  ​716  ​|  ​42  | 
-|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,026  ​| ​ 1,325  ​| ​ 1,137  ​|  ​352  |+|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,041  ​| ​ 1,330  ​| ​ 1,141  ​|  ​355  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,027  ​| ​ 1,325  ​| ​ 1,137  ​|  ​353  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  2,042  ​| ​ 1,330  ​| ​ 1,141  ​|  ​356  |
 |  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  23  |  15  |  19  |  12  | |  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  23  |  15  |  19  |  12  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 121: Line 119:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Human papillomavirus (16)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​253  ​|  ​185  ​|  ​172  ​|  ​24  |+|  **//Human papillomavirus (16)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​263  ​|  ​188  ​|  ​175  ​|  ​28  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​253  ​|  ​185  ​|  ​172  ​|  ​24  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​263  ​|  ​188  ​|  ​175  ​|  ​28  |
 |  **//Human papillomavirus (6b)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  20  |  20  |  22  |  2  | |  **//Human papillomavirus (6b)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  20  |  20  |  22  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  20  |  20  |  22  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  20  |  20  |  22  |  2  |
-|  **//Macaca mulatta//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​22  ​|  ​13  ​|  ​15  ​|  ​13  |+|  **//​Leishmania major (Friedlin)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  **//Macaca mulatta//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​23  ​|  ​14  ​|  ​17  ​|  ​14  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​22  ​|  ​13  ​|  ​15  ​|  ​13  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​23  ​|  ​14  ​|  ​17  ​|  ​14  |
 |  **//​Meleagris gallopavo//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  **//​Meleagris gallopavo//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  47,053  ​|  ​40,702  ​| ​ 13,306  ​|  ​3,968  |+|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  47,951  ​|  ​41,532  ​| ​ 13,451  ​|  ​4,008  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  382  |  337  |  341  |  194  | |  :::  |  GENETIC ​ |  382  |  337  |  341  |  194  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​47,435  ​|  ​40,964  ​| ​ 13,366  ​| ​ 4,105  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​48,333  ​|  ​41,794  ​| ​ 13,511  ​| ​ 4,145  |
 |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12  |  10  |  13  |  3  | |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12  |  10  |  13  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 145: Line 146:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//​Oryctolagus cuniculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​316  ​|  ​282  ​|  ​289  ​|  ​65  |+|  **//​Oryctolagus cuniculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​318  ​|  ​284  ​|  ​293  ​|  ​66  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​316  ​|  ​282  ​|  ​289  ​|  ​65  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​318  ​|  ​284  ​|  ​293  ​|  ​66  |
 |  **//Oryza sativa (Japonica)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  343  |  327  |  310  |  20  | |  **//Oryza sativa (Japonica)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  343  |  327  |  310  |  20  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
Line 163: Line 164:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  |
-|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  7,779  ​| ​ 6,628  ​| ​ 4,159  ​| ​ 1,158  |+|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  7,829  ​| ​ 6,653  ​| ​ 4,173  ​| ​ 1,165  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  7,798  ​| ​ 6,638  ​| ​ 4,169  ​| ​ 1,161  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  7,848  ​| ​ 6,663  ​| ​ 4,183  ​| ​ 1,168  |
 |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
-|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​171,959  ​|  ​114,693  ​| ​ 6,909  ​| ​ 9,422  | +|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​173,640  ​|  ​115,729  ​| ​ 6,917  ​| ​ 9,520  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​576,131  ​| ​ 441,069  ​| ​ 5,958  ​| ​ 9,156  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​577,610  ​| ​ 441,949  ​| ​ 5,960  ​| ​ 9,244  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​748,090  ​|  ​542,419  ​| ​ 7,165  ​| ​ 15,613  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​751,250  ​|  ​544,097  ​| ​ 7,172  ​| ​ 15,761  | 
-|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​15,294  ​|  ​11,210  ​| ​ 3,279  ​| ​ 1,520  | +|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​17,054  ​|  ​12,843  ​| ​ 3,558  ​| ​ 1,555  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​60,572  ​| ​ 51,034  ​| ​ 3,479  ​| ​ 1,871  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​61,517  ​| ​ 51,879  ​| ​ 3,556  ​| ​ 1,912  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​75,866  ​|  ​61,263  ​| ​ 4,469  ​| ​ 2,681  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​78,571  ​|  ​63,640  ​| ​ 4,620  ​| ​ 2,742  |
 |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  | |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
Line 208: Line 209:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,384  ​| ​ 1,228  ​| ​ 1,128  ​|  ​226  |+|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,408  ​| ​ 1,246  ​| ​ 1,141  ​|  ​229  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,391  ​| ​ 1,235  ​| ​ 1,138  ​|  ​229  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,415  ​| ​ 1,253  ​| ​ 1,151  ​|  ​232  |
 |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
-|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​873,288  ​|  ​657,116  ​|  ​68,258  ​|  ​48,746  | +|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​904,306  ​|  ​683,985  ​|  ​71,614  ​|  ​49,464  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​833,406  ​|  ​682,512  ​|  ​20,946  ​| ​ 16,059  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​835,837  ​|  ​684,244  ​|  ​21,032  ​| ​ 16,191  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,706,694  ​| ​ 1,322,353  ​|  ​73,159  ​|  ​59,803  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,740,143  ​| ​ 1,350,574  ​|  ​76,129  ​|  ​60,595  |
  
 ===== Chemical Interaction Statistics ===== ===== Chemical Interaction Statistics =====
Line 274: Line 275:
 |  :::  |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  1,093  |  0  |  903  |  75  | |  :::  |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  1,093  |  0  |  903  |  75  |
 |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  4,392  |  0  |  2,317  |  330  | |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  4,392  |  0  |  2,317  |  330  |
-|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​557,255  ​|  ​292,806  ​| ​ 39,​038 ​ |  ​50,371  ​|  ​10,466  ​| ​ 3,117  | +|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​705,673  ​|  ​383,699  ​| ​ 39,​038 ​ |  ​54,962  ​|  ​11,895  ​| ​ 3,118  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​557,255  ​|  ​292,806  ​| ​ 45,​249 ​ |  ​50,371  ​|  ​10,703  ​| ​ 3,407  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​705,673  ​|  ​383,699  ​| ​ 45,​249 ​ |  ​54,962  ​|  ​12,022  ​| ​ 3,408  |
 |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  | |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  |
 |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  3  |  4  | |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  3  |  4  |
Line 317: Line 318:
 |  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  42,​907 ​ |  19,​981 ​ |  0  |  3,165  |  3,165  |  528  | |  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  42,​907 ​ |  19,​981 ​ |  0  |  3,165  |  3,165  |  528  |
 |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  5,898  |  0  |  3,195  |  433  | |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  5,898  |  0  |  3,195  |  433  |
-|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​626,075  ​|  ​347,307  ​| ​ 49,​605 ​ |  ​66,730  ​|  ​18,093  ​| ​ 3,740  |+|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​774,493  ​|  ​438,200  ​| ​ 49,​605 ​ |  ​71,321  ​|  ​19,522  ​| ​ 3,741  |
 |  :::  |  UFMYLATION ​ |  0  |  0  |  10  |  0  |  10  |  1  | |  :::  |  UFMYLATION ​ |  0  |  0  |  10  |  0  |  10  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​668,982  ​|  ​367,288  ​| ​ 57,​396 ​ |  ​68,099  ​|  ​19,194  ​| ​ 4,642  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​817,400  ​|  ​458,181  ​| ​ 57,​396 ​ |  ​72,690  ​|  ​20,513  ​| ​ 4,643  |
  
  
Line 325: Line 326:
 ====== Previous Build Statistics ====== ====== Previous Build Statistics ======
 ==== 2019 Updates ====  ==== 2019 Updates ==== 
 +  * **[[Build 3.5.177]]**
 +  * **[[Build 3.5.176]]**
 +  * **[[Build 3.5.175]]**
   * **[[Build 3.5.174]]**   * **[[Build 3.5.174]]**
   * **[[Build 3.5.173]]**   * **[[Build 3.5.173]]**
 
statistics.txt · Last modified: 2024/04/30 21:47 by biogridadmin