Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
statistics [2019/08/31 23:58]
biogridadmin
statistics [2019/10/01 01:43] (current)
biogridadmin
Line 4: Line 4:
   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.
   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.
-====== Current Build Statistics (3.5.176) - September ​2019 ====== +====== Current Build Statistics (3.5.177) - October ​2019 ======
- +
  
 ===== Physical and Genetic Interaction Statistics ===== ===== Physical and Genetic Interaction Statistics =====
Line 16: Line 14:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//​Arabidopsis thaliana (Columbia)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  55,613  ​| ​ 48,572  ​| ​ 10,417  ​| ​ 2,298  |+|  **//​Arabidopsis thaliana (Columbia)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  55,621  ​| ​ 48,577  ​| ​ 10,418  ​| ​ 2,299  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  350  |  282  |  304  |  154  | |  :::  |  GENETIC ​ |  350  |  282  |  304  |  154  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  55,963  ​| ​ 48,767  ​| ​ 10,467  ​| ​ 2,378  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  55,971  ​| ​ 48,772  ​| ​ 10,468  ​| ​ 2,379  |
 |  **//​Bacillus subtilis (168)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  3  |  2  | |  **//​Bacillus subtilis (168)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  3  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 73: Line 71:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  | |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  184,​023 ​ |  181,​621 ​ |  4,063  |  7  | |  :::  |  COMBINED ​ |  184,​023 ​ |  181,​621 ​ |  4,063  |  7  |
-|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​509  ​|  ​432  ​|  ​406  ​|  ​94  |+|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​510  ​|  ​433  ​|  ​408  ​|  ​95  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  | |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​522  ​|  ​441  ​|  ​414  ​|  ​103  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​523  ​|  ​442  ​|  ​416  ​|  ​104  |
 |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
-|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​204  ​|  ​134  ​|  ​136  ​|  ​36  |+|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​207  ​|  ​135  ​|  ​137  ​|  ​37  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​204  ​|  ​134  ​|  ​136  ​|  ​36  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​207  ​|  ​135  ​|  ​137  ​|  ​37  | 
-|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​519,575  ​|  ​386,902  ​| ​ 24,006  ​| ​ 30,070  |+|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​523,461  ​|  ​389,300  ​| ​ 24,024  ​| ​ 30,257  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  7,808  |  7,716  |  2,678  |  335  | |  :::  |  GENETIC ​ |  7,808  |  7,716  |  2,678  |  335  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​527,383  ​|  ​393,981  ​| ​ 24,355  ​| ​ 30,203  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​531,269  ​|  ​396,364  ​| ​ 24,373  ​| ​ 30,390  |
 |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  265  |  204  |  173  |  48  | |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  265  |  204  |  173  |  48  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  |
Line 112: Line 110:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  779  |  693  |  716  |  42  | |  :::  |  COMBINED ​ |  779  |  693  |  716  |  42  |
-|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,027  ​| ​ 1,326  ​| ​ 1,138  ​|  ​353  |+|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,041  ​| ​ 1,330  ​| ​ 1,141  ​|  ​355  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,028  ​| ​ 1,326  ​| ​ 1,138  ​|  ​354  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  2,042  ​| ​ 1,330  ​| ​ 1,141  ​|  ​356  |
 |  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  23  |  15  |  19  |  12  | |  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  23  |  15  |  19  |  12  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 121: Line 119:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Human papillomavirus (16)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​257  ​|  ​186  ​|  ​173  ​|  ​26  |+|  **//Human papillomavirus (16)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​263  ​|  ​188  ​|  ​175  ​|  ​28  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​257  ​|  ​186  ​|  ​173  ​|  ​26  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​263  ​|  ​188  ​|  ​175  ​|  ​28  |
 |  **//Human papillomavirus (6b)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  20  |  20  |  22  |  2  | |  **//Human papillomavirus (6b)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  20  |  20  |  22  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 130: Line 128:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Macaca mulatta//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​22  ​|  ​13  ​|  ​15  ​|  ​13  |+|  **//Macaca mulatta//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​23  ​|  ​14  ​|  ​17  ​|  ​14  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​22  ​|  ​13  ​|  ​15  ​|  ​13  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​23  ​|  ​14  ​|  ​17  ​|  ​14  |
 |  **//​Meleagris gallopavo//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  **//​Meleagris gallopavo//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  47,905  ​| ​ 41,504  ​| ​ 13,448  ​|  ​3,995  |+|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  47,951  ​| ​ 41,532  ​| ​ 13,451  ​|  ​4,008  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  382  |  337  |  341  |  194  | |  :::  |  GENETIC ​ |  382  |  337  |  341  |  194  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  48,287  ​| ​ 41,766  ​| ​ 13,508  ​| ​ 4,132  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  48,333  ​| ​ 41,794  ​| ​ 13,511  ​| ​ 4,145  |
 |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12  |  10  |  13  |  3  | |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12  |  10  |  13  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 148: Line 146:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//​Oryctolagus cuniculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​316  ​|  ​282  ​|  ​289  ​|  ​65  |+|  **//​Oryctolagus cuniculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​318  ​|  ​284  ​|  ​293  ​|  ​66  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​316  ​|  ​282  ​|  ​289  ​|  ​65  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​318  ​|  ​284  ​|  ​293  ​|  ​66  |
 |  **//Oryza sativa (Japonica)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  343  |  327  |  310  |  20  | |  **//Oryza sativa (Japonica)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  343  |  327  |  310  |  20  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
Line 166: Line 164:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  |
-|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  7,826  ​| ​ 6,653  |  4,173  |  1,163  |+|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  7,829  ​| ​ 6,653  |  4,173  |  1,165  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  7,845  ​| ​ 6,663  |  4,183  |  1,166  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  7,848  ​| ​ 6,663  |  4,183  |  1,168  |
 |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
-|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​172,448  ​|  ​114,925  ​| ​ 6,913  ​| ​ 9,472  | +|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​173,640  ​|  ​115,729  ​| ​ 6,917  ​| ​ 9,520  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​576,462  ​| ​ 441,188  ​| ​ 5,958  ​| ​ 9,200  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​577,610  ​| ​ 441,949  ​| ​ 5,960  ​| ​ 9,244  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​748,910  ​|  ​542,735  ​| ​ 7,168  ​| ​ 15,689  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​751,250  ​|  ​544,097  ​| ​ 7,172  ​| ​ 15,761  | 
-|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​15,929  ​|  ​11,800  ​| ​ 3,338  ​| ​ 1,534  | +|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​17,054  ​|  ​12,843  ​| ​ 3,558  ​| ​ 1,555  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  61,409  ​| ​ 51,819  ​| ​ 3,552  ​| ​ 1,889  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  61,517  ​| ​ 51,879  ​| ​ 3,556  ​| ​ 1,912  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​77,338  ​|  ​62,634  ​| ​ 4,535  ​| ​ 2,706  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​78,571  ​|  ​63,640  ​| ​ 4,620  ​| ​ 2,742  |
 |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  | |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
Line 211: Line 209:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,406  ​| ​ 1,244  ​| ​ 1,140  ​|  ​228  |+|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,408  ​| ​ 1,246  ​| ​ 1,141  ​|  ​229  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,413  ​| ​ 1,251  ​| ​ 1,150  ​|  ​231  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,415  ​| ​ 1,253  ​| ​ 1,151  ​|  ​232  |
 |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
-|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​898,063  ​|  ​679,718  ​| ​ 71,373  ​| ​ 49,205  | +|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​904,306  ​|  ​683,985  ​| ​ 71,614  ​| ​ 49,464  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​834,581  ​|  ​683,423  ​| ​ 21,026  ​| ​ 16,124  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​835,837  ​|  ​684,244  ​| ​ 21,032  ​| ​ 16,191  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,732,644  ​| ​ 1,345,800  ​| ​ 76,023  ​| ​ 60,297  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,740,143  ​| ​ 1,350,574  ​| ​ 76,129  ​| ​ 60,595  |
  
 ===== Chemical Interaction Statistics ===== ===== Chemical Interaction Statistics =====
Line 328: Line 326:
 ====== Previous Build Statistics ====== ====== Previous Build Statistics ======
 ==== 2019 Updates ====  ==== 2019 Updates ==== 
 +  * **[[Build 3.5.177]]**
   * **[[Build 3.5.176]]**   * **[[Build 3.5.176]]**
   * **[[Build 3.5.175]]**   * **[[Build 3.5.175]]**
 
statistics.txt · Last modified: 2019/10/01 01:43 by biogridadmin