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   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.
   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.
-====== Current Build Statistics (3.5.175) - August 2019 ====== +====== Current Build Statistics (4.4.231) - March 2024 ======
  
 ===== Physical and Genetic Interaction Statistics ===== ===== Physical and Genetic Interaction Statistics =====
 ^  Organism ​ ^  Experiment Type  ^  Raw Interactions ​ ^  Non-Redundant Interactions ​ ^  Unique Genes  ^  Unique Publications ​ ^ ^  Organism ​ ^  Experiment Type  ^  Raw Interactions ​ ^  Non-Redundant Interactions ​ ^  Unique Genes  ^  Unique Publications ​ ^
 +|  **//Anas platyrhynchos//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  3  |  3  |  2  |
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  3  |  3  |  2  |
 |  **//​Anopheles gambiae (PEST)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  1  |  2  |  2  | |  **//​Anopheles gambiae (PEST)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  1  |  2  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
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 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//​Arabidopsis thaliana (Columbia)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​55,613  ​|  ​48,572  ​|  ​10,417  ​| ​ 2,298  | +|  **//​Arabidopsis thaliana (Columbia)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​82,309  ​|  ​74,004  ​|  ​11,740  ​| ​ 2,364  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​350  ​|  ​282  ​|  ​304  ​|  ​154  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​362  ​|  ​294  ​|  ​322  ​|  ​164  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​55,963  ​|  ​48,767  ​|  ​10,467  ​| ​ 2,378  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​82,671  ​|  ​74,205  ​|  ​11,787  ​| ​ 2,445  | 
-|  **//​Bacillus subtilis (168)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//​Bacillus subtilis (168)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​18  ​|  ​11  ​|  ​ ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​18  ​|  ​11  ​|  ​ ​|  ​ | 
-|  **//Bos taurus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​480  ​|  ​432  ​|  ​456  ​|  ​192  |+|  **//Bos taurus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​649  ​|  ​575  ​|  ​595  ​|  ​226  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​480  ​|  ​432  ​|  ​456  ​|  ​192  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​649  ​|  ​575  ​|  ​595  ​|  ​226  | 
-|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​22,093  ​|  ​21,446  ​|  ​5,910  ​|  ​201  | +|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​41,432  ​|  ​37,770  ​|  ​8,668  ​|  ​1,519  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  2,338  ​| ​ 2,271  ​| ​ 1,133  ​|  ​35  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  2,348  ​| ​ 2,281  ​| ​ 1,140  ​|  ​37  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​24,431  ​|  ​23,678  ​|  ​6,337  ​|  ​219  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​43,780  ​|  ​39,997  ​|  ​8,869  ​|  ​1,539  | 
-|  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,450  ​| ​ 1,226  ​|  ​876  ​|  ​166  | +|  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,558  ​| ​ 1,327  ​|  ​948  ​|  ​173  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​527  ​|  ​450  ​|  ​369  ​|  ​35  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​531  ​|  ​454  ​|  ​376  ​|  ​39  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,977  ​| ​ 1,652  ​| ​ 1,139  ​|  ​180  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​2,089  ​| ​ 1,756  ​| ​ 1,210  ​|  ​191  | 
-|  **//Canis familiaris//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​138  ​|  ​126  ​|  ​144  ​|  ​26  |+|  **//Canis familiaris//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​558  ​|  ​540  ​|  ​530  ​|  ​34  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​138  ​|  ​126  ​|  ​144  ​|  ​26  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​558  ​|  ​540  ​|  ​530  ​|  ​34  | 
-|  **//Cavia porcellus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//Cavia porcellus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​10  ​|  ​ ​|  ​14  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​10  ​|  ​ ​|  ​14  ​|  ​ |
 |  **//​Chlamydomonas reinhardtii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  17  |  16  |  19  |  4  | |  **//​Chlamydomonas reinhardtii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  17  |  16  |  19  |  4  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  19  |  4  | |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  19  |  4  |
-|  **//​Chlorocebus sabaeus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​17  ​|  ​15  ​|  ​18  ​|  ​ |+|  **//​Chlorocebus sabaeus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​59  ​|  ​53  ​|  ​75  ​|  ​21  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​17  ​|  ​15  ​|  ​18  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​59  ​|  ​53  ​|  ​75  ​|  ​21  | 
-|  **//​Cricetulus griseus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​58  ​|  ​57  ​|  ​69  ​|  ​12  |+|  **//​Cricetulus griseus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​67  ​|  ​64  ​|  ​80  ​|  ​19  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​58  ​|  ​57  ​|  ​69  ​|  ​12  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​67  ​|  ​64  ​|  ​80  ​|  ​19  | 
-|  **//Danio rerio//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​248  ​|  ​210  ​|  ​207  ​|  ​42  |+|  **//Danio rerio//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​506  ​|  ​464  ​|  ​461  ​|  ​50  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  | |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​319  ​|  ​272  ​|  ​263  ​|  ​71  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​577  ​|  ​526  ​|  ​517  ​|  ​79  | 
-|  **//​Dictyostelium discoideum (AX4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​32  ​|  ​19  ​|  ​23  ​|  ​ |+|  **//​Dictyostelium discoideum (AX4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​79  ​|  ​66  ​|  ​72  ​|  ​11  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  8  |  2  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  8  |  2  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​38  ​|  ​22  ​|  ​27  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​85  ​|  ​69  ​|  ​76  ​|  ​12  | 
-|  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​62,208  ​|  ​52,404  ​|  ​9,003  ​|  ​3,685  | +|  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​69,520  ​|  ​57,781  ​|  ​10,333  ​|  ​4,368  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​14,475  ​| ​ 10,140  ​| ​ 3,146  ​| ​ 4,394  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​15,348  ​| ​ 10,764  ​| ​ 3,294  ​| ​ 4,640  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​76,683  ​|  ​61,191  ​|  ​9,340  ​|  ​7,153  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​84,868  ​|  ​67,080  ​|  ​10,671  ​|  ​8,040  |
 |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  | |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  71  |  62  |  64  |  6  | |  :::  |  COMBINED ​ |  71  |  62  |  64  |  6  |
-|  **//Equus caballus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//Equus caballus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |
 |  **//​Escherichia coli (K12)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//​Escherichia coli (K12)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//​Escherichia coli (K12/​MC4100/​BW2952)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​10  ​|  ​ |+|  **//​Escherichia coli (K12/​MC4100/​BW2952)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​10  ​|  ​10  ​|  ​12  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​10  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​10  ​|  ​10  ​|  ​12  ​|  ​ | 
-|  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2,299  ​| ​ 2,117  ​| ​ 1,303  ​|  ​26  |+|  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2,288  ​| ​ 2,104  ​| ​ 1,287  ​|  ​36  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  26  |  25  |  36  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  26  |  25  |  36  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,325  ​| ​ 2,141  ​| ​ 1,334  ​|  ​38  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  2,314  ​| ​ 2,128  ​| ​ 1,318  ​|  ​48  |
 |  **//​Escherichia coli (K12/​W3110)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12,​804 ​ |  12,​801 ​ |  2,045  |  3  | |  **//​Escherichia coli (K12/​W3110)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12,​804 ​ |  12,​801 ​ |  2,045  |  3  |
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​171,219  ​|  ​169,594  ​| ​ 3,973  ​|  ​ | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​186,493  ​|  ​184,791  ​| ​ 3,980  ​|  ​ | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​184,023  ​|  ​181,621  ​| ​ 4,063  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​199,297  ​|  ​196,815  ​| ​ 4,068  |  8  | 
-|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​509  ​|  ​432  ​|  ​406  ​|  ​94  |+|  **//Felis Catus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  1  |  2  |  5  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  1  |  2  ​|  ​ | 
 +|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​561  ​|  ​478  ​|  ​452  ​|  ​117  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  | |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​522  ​|  ​441  ​|  ​414  ​|  ​103  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​574  ​|  ​487  ​|  ​460  ​|  ​126  |
 |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
-|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​204  ​|  ​134  ​|  ​136  ​|  ​36  |+|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​613  ​|  ​492  ​|  ​493  ​|  ​57  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​204  ​|  ​134  ​|  ​136  ​|  ​36  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​613  ​|  ​492  ​|  ​493  ​|  ​57  | 
-|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​516,942  ​|  ​384,954  ​|  ​23,972  ​|  ​29,919  | +|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​1,278,854  ​|  ​970,420  ​|  ​28,023  ​|  ​38,121  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​7,808  ​|  ​7,716  ​|  ​2,678  ​|  ​335  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​18,966  ​|  ​18,476  ​|  ​7,441  ​|  ​399  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​524,750  ​|  ​392,033  ​|  ​24,322  ​|  ​30,052  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,297,820  ​|  ​987,179  ​|  ​28,463  ​|  ​38,294  | 
-|  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  ​265  ​|  ​204  ​|  ​173  ​|  ​48  |+|  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  ​326  ​|  ​250  ​|  ​202  ​|  ​71  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​271  ​|  ​209  ​|  ​178  ​|  ​48  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​332  ​|  ​255  ​|  ​207  ​|  ​71  |
 |  **//Human Herpesvirus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  12  |  6  |  10  |  5  | |  **//Human Herpesvirus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  12  |  6  |  10  |  5  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  12  |  6  |  10  |  5  | |  :::  |  COMBINED ​ |  12  |  6  |  10  |  5  |
-|  **//Human Herpesvirus 3//**  |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//Human Herpesvirus 3//**  |  PHYSICAL ​ |  ​16  ​|  ​12  ​|  ​15  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​16  ​|  ​12  ​|  ​15  ​|  ​ | 
-|  **//Human Herpesvirus 4//**  |  PHYSICAL ​ |  ​429  ​|  ​326  ​|  ​323  ​|  ​47  |+|  **//Human Herpesvirus 4//**  |  PHYSICAL ​ |  ​680  ​|  ​544  ​|  ​505  ​|  ​59  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​429  ​|  ​326  ​|  ​323  ​|  ​47  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​680  ​|  ​544  ​|  ​505  ​|  ​59  | 
-|  **//Human Herpesvirus 5//**  |  PHYSICAL ​ |  ​125  ​|  ​87  ​|  ​99  ​|  ​27  |+|  **//Human Herpesvirus 5//**  |  PHYSICAL ​ |  ​202  ​|  ​134  ​|  ​146  ​|  ​41  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​125  ​|  ​87  ​|  ​99  ​|  ​27  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​202  ​|  ​134  ​|  ​146  ​|  ​41  |
 |  **//Human Herpesvirus 6A//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  11  |  8  |  12  |  7  | |  **//Human Herpesvirus 6A//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  11  |  8  |  12  |  7  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 108: Line 113:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Human Herpesvirus 8//**  |  PHYSICAL ​ |  ​779  ​|  ​693  ​|  ​716  ​|  ​42  |+|  **//Human Herpesvirus 8//**  |  PHYSICAL ​ |  ​1,011  ​|  ​901  ​|  ​890  ​|  ​49  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​779  ​|  ​693  ​|  ​716  ​|  ​42  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,011  ​|  ​901  ​|  ​890  ​|  ​49  | 
-|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,026  ​| ​ 1,325  ​| ​ 1,137  ​|  ​352  |+|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,533  ​| ​ 1,737  ​| ​ 1,443  ​|  ​401  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,027  ​| ​ 1,325  ​| ​ 1,137  ​|  ​353  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  2,534  ​| ​ 1,737  ​| ​ 1,443  ​|  ​402  | 
-|  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​23  ​|  ​15  ​|  ​19  ​|  ​12  |+|  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​91  ​|  ​80  ​|  ​63  ​|  ​14  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​23  ​|  ​15  ​|  ​19  ​|  ​12  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​91  ​|  ​80  ​|  ​63  ​|  ​14  | 
-|  **//Human papillomavirus (10)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//Human papillomavirus (10)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ | 
-|  **//Human papillomavirus (16)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​255  ​|  ​186  ​|  ​173  ​|  ​25  |+|  **//Human papillomavirus (16)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​660  ​|  ​511  ​|  ​484  ​|  ​41  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​255  ​|  ​186  ​|  ​173  ​|  ​25  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​660  ​|  ​511  ​|  ​484  ​|  ​41  | 
-|  **//Human papillomavirus (6b)//**  |  PHYSICAL ​ |  ​20  ​|  ​20  ​|  ​22  ​|  ​ |+|  **//Human papillomavirus (32)//**  |  PHYSICAL ​ |  ​62  ​|  ​58  ​|  ​57  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​20  ​|  ​20  ​|  ​22  ​| ​ 2  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​62  ​|  ​58  ​|  ​57  |  1  | 
 +|  **//Human papillomavirus (5)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  146  |  132  |  128  ​| ​ 2  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  146  |  132  |  128  |  2  | 
 +|  **//Human papillomavirus (6b)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  592  |  581  |  459  |  4  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  592  |  581  |  459  |  4  | 
 +|  **//Human papillomavirus (7)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  **//Human papillomavirus (9)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  96  |  87  |  84  |  1  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  96  |  87  |  84  |  1  |
 |  **//​Leishmania major (Friedlin)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//​Leishmania major (Friedlin)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Macaca mulatta//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​22  ​|  ​13  ​|  ​15  ​|  ​13  |+|  **//Macaca mulatta//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​316  ​|  ​305  ​|  ​310  ​|  ​19  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​22  ​|  ​13  ​|  ​15  ​|  ​13  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​316  ​|  ​305  ​|  ​310  ​|  ​19  |
 |  **//​Meleagris gallopavo//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  **//​Meleagris gallopavo//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//Mus musculus//**  |  PHYSICAL ​ |  ​47,804  ​|  ​41,421  ​|  ​13,​435 ​ |  3,986  | +|  **//Middle-East Respiratory Syndrome-related Coronavirus//**  |  PHYSICAL ​ |  ​1,106  ​|  ​1,051  ​|  ​987  ​|  ​64  |
-|  :::  |  GENETIC ​ |  382  |  337  |  341  |  194  | +
-|  :::  |  COMBINED ​ |  48,​186 ​ |  41,​683 ​ |  13,​495 ​ |  4,123  | +
-|  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12  |  10  |  13  ​|  ​ |+
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​12  ​|  ​10  ​|  ​13  ​| ​ 3  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,106  ​|  ​1,051  ​|  ​987  |  64  | 
-|  **//​Neurospora crassa (OR74A)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​11  ​|  ​10  ​|  ​12  ​|  ​ |+|  **//​Monodelphis domestica//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  4  |  2  ​| ​ 3  ​| ​ 1  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  4  |  2  |  3  |  1  | 
 +|  **//Murid Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  100,​204 ​ |  91,​546 ​ |  18,​144 ​ |  4,694  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  938  |  890  |  833  |  209  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  101,​142 ​ |  92,​351 ​ |  18,​282 ​ |  4,842  | 
 +|  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  24  |  20  |  25  |  7  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  24  |  20  |  25  |  7  | 
 +|  **//Myotis lucifugus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | 
 +|  **//​Neurospora crassa (OR74A)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​33  ​|  ​32  ​|  ​35  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​11  ​|  ​10  ​|  ​12  ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​33  ​|  ​32  ​|  ​35  ​|  ​ |
 |  **//​Nicotiana tomentosiformis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  2  |  1  | |  **//​Nicotiana tomentosiformis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//​Oryctolagus cuniculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​316  ​|  ​282  ​|  ​289  ​|  ​65  |+|  **//​Oryctolagus cuniculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​385  ​|  ​340  ​|  ​350  ​|  ​74  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​316  ​|  ​282  ​|  ​289  ​|  ​65  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​385  ​|  ​340  ​|  ​350  ​|  ​74  | 
-|  **//Oryza sativa (Japonica)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​343  ​|  ​327  ​|  ​310  ​|  ​20  |+|  **//Oryza sativa (Japonica)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​364  ​|  ​344  ​|  ​328  ​|  ​23  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​345  ​|  ​329  ​|  ​310  ​|  ​20  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​366  ​|  ​346  ​|  ​328  ​|  ​23  |
 |  **//Ovis aries//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//Ovis aries//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Pan troglodytes//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​10  ​|  ​ |+|  **//Pan troglodytes//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​49  ​|  ​48  ​|  ​54  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​10  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​49  ​|  ​48  ​|  ​54  ​|  ​ | 
-|  **//​Pediculus humanus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//​Pediculus humanus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ | 
-|  **//​Plasmodium falciparum (3D7)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2,545  ​| ​ 2,508  ​| ​ 1,227  ​|  ​ |+|  **//​Plasmodium falciparum (3D7)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2,552  ​| ​ 2,511  ​| ​ 1,232  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  ​| ​ 2,508  ​| ​ 1,227  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  2,552  ​| ​ 2,511  ​| ​ 1,232  ​|  ​ | 
-|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​7,798  ​|  ​6,639  ​|  ​4,166  ​| ​ 1,162  |+|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​10,571  ​|  ​9,167  ​|  ​5,080  ​| ​ 1,387  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​7,817  ​|  ​6,649  ​|  ​4,176  ​| ​ 1,165  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​10,590  ​|  ​9,177  ​|  ​5,090  ​| ​ 1,390  |
 |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
-|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​172,084  ​|  ​114,758  ​|  ​6,913  ​|  ​9,449  | +|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​252,946  ​|  ​172,715  ​|  ​7,188  ​|  ​10,783  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​576,220  ​|  ​441,111  ​| ​ 5,958  ​|  ​9,177  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​596,276  ​|  ​455,255  ​| ​ 5,979  ​|  ​10,383  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​748,304  ​|  ​542,510  ​| ​ 7,168  ​|  ​15,651  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​849,222  ​|  ​609,756  ​| ​ 7,405  ​|  ​17,718  | 
-|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​15,899  ​|  ​11,789  ​| ​ 3,335  ​| ​ 1,525  | +|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​19,221  ​|  ​14,637  ​| ​ 3,844  ​| ​ 1,691  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​60,688  ​|  ​51,126  ​| ​ 3,491  ​|  ​1,876  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​62,702  ​|  ​52,774  ​| ​ 3,645  ​|  ​2,058  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​76,587  ​|  ​61,932  ​| ​ 4,504  ​| ​ 2,688  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​81,923  ​|  ​66,238  ​| ​ 4,755  ​| ​ 2,982  |
 |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  | |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  10  |  8  |  6  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  10  |  8  |  6  |  1  |
-|  **//Simian Immunodeficiency Virus//**  |  PHYSICAL ​ |  ​34  ​|  ​16  ​|  ​19  ​|  ​16  |+|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus//**  |  PHYSICAL ​ |  ​2,446  ​|  ​1,934  ​|  ​1,547  ​|  ​282  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​34  ​|  ​16  ​|  ​19  ​|  ​16  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​2,446  ​|  ​1,934  ​|  ​1,547  ​|  ​282  | 
-|  **//Simian Virus 40//**  |  PHYSICAL ​ |  ​11  ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​39,​793 ​ ​|  ​26,​681 ​ ​|  ​7,032  ​|  ​1,263  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​11  ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​39,​793 ​ ​|  ​26,​681 ​ ​|  ​7,032  ​|  ​1,263  | 
 +|  **//Simian Immunodeficiency Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  37  |  18  |  21  |  18  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  37  |  18  |  21  |  18  | 
 +|  **//Simian Virus 40//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  8  |  9  |  13  | 
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | 
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  8  |  9  |  13  |
 |  **//Solanum lycopersicum//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  137  |  107  |  44  |  8  | |  **//Solanum lycopersicum//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  137  |  107  |  44  |  8  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  4  |  4  |  4  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  4  |  4  |  4  |  1  |
Line 192: Line 227:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  3  |  5  |  3  | |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  3  |  5  |  3  |
 +|  **//Sorghum bicolor//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 +|  **//​Streptococcus pneumoniae (ATCCBAA255)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  16  |  9  |  6  |  1  |
 +|  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  16  |  9  |  6  |  1  |
 |  **//​Strongylocentrotus purpuratus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  17  |  16  |  17  |  3  | |  **//​Strongylocentrotus purpuratus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  17  |  16  |  17  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  17  |  3  | |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  17  |  3  |
-|  **//Sus scrofa//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​84  ​|  ​80  ​|  ​96  ​|  ​29  |+|  **//Sus scrofa//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​116  ​|  ​104  ​|  ​125  ​|  ​45  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​84  ​|  ​80  ​|  ​96  ​|  ​29  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​116  ​|  ​104  ​|  ​125  ​|  ​45  |
 |  **//Tobacco Mosaic Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  3  |  1  | |  **//Tobacco Mosaic Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  3  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 204: Line 245:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  4  |  4  |  4  |  4  | |  :::  |  COMBINED ​ |  4  |  4  |  4  |  4  |
-|  **//​Vaccinia Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  **//​Vaccinia Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​18  ​|  ​10  ​|  ​13  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​18  ​|  ​10  ​|  ​13  ​|  ​ |
 |  **//Vitis vinifera//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//Vitis vinifera//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​1,406  ​|  ​1,244  ​| ​ 1,140  ​|  ​228  |+|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​2,452  ​|  ​2,057  ​| ​ 1,580  ​|  ​272  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,413  ​|  ​1,251  ​| ​ 1,150  ​|  ​231  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​2,459  ​|  ​2,064  ​| ​ 1,589  ​|  ​275  |
 |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
-|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​894,880  ​|  ​677,442  ​|  ​71,266  ​|  ​49,019  | +|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​1,843,​877 ​ ​|  ​1,416,813  ​|  ​84,081  ​|  ​61,356  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​833,618  ​|  ​682,653  ​|  ​20,965  ​|  ​16,089  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​883,522  ​|  ​725,556  ​|  ​26,541  ​|  ​17,802  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,728,498  ​|  ​1,342,777  ​|  ​75,892  ​|  ​60,088  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​2,727,399  ​|  ​2,118,782  ​|  ​88,325  ​|  ​73,533  |
  
 ===== Chemical Interaction Statistics ===== ===== Chemical Interaction Statistics =====
Line 227: Line 268:
 |  **//​Escherichia coli (K12)//​** ​ |  5  |  2  |  2  |  3  |  2  | |  **//​Escherichia coli (K12)//​** ​ |  5  |  2  |  2  |  3  |  2  |
 |  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  1,590  |  834  |  287  |  137  |  583  | |  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  1,590  |  834  |  287  |  137  |  583  |
-|  **//Homo sapiens//​** ​ |  ​25,841  ​|  ​10,854  ​| ​ 2,183  ​|  ​8,944  ​|  ​4,593  |+|  **//Homo sapiens//​** ​ |  ​28,619  ​|  ​12,296  ​| ​ 2,294  ​|  ​9,543  ​|  ​5,854  |
 |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  65  |  24  |  3  |  24  |  21  | |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  65  |  24  |  3  |  24  |  21  |
 |  **//Human Herpesvirus 4//**  |  10  |  3  |  3  |  6  |  3  | |  **//Human Herpesvirus 4//**  |  10  |  3  |  3  |  6  |  3  |
 |  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  105  |  53  |  2  |  48  |  53  | |  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  105  |  53  |  2  |  48  |  53  |
 |  **//​Leishmania major (Friedlin)//​** ​ |  8  |  4  |  1  |  2  |  4  | |  **//​Leishmania major (Friedlin)//​** ​ |  8  |  4  |  1  |  2  |  4  |
 +|  **//​Middle-East Respiratory Syndrome-related Coronavirus//​** ​ |  18  |  18  |  5  |  12  |  18  |
 |  **//Mus musculus//​** ​ |  2  |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//Mus musculus//​** ​ |  2  |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  **//​Mycobacterium tuberculosis (CDC1551)//​** ​ |  3  |  3  |  3  |  1  |  3  | |  **//​Mycobacterium tuberculosis (CDC1551)//​** ​ |  3  |  3  |  3  |  1  |  3  |
Line 239: Line 281:
 |  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  2  |  2  |  1  |  2  |  2  | |  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  2  |  2  |  1  |  2  |  2  |
 |  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  7  |  7  |  2  |  2  |  7  | |  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  7  |  7  |  2  |  2  |  7  |
 +|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus//​** ​ |  30  |  30  |  7  |  22  |  29  |
 +|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2//**  |  225  |  214  |  12  |  125  |  198  |
 |  **//​Streptococcus pneumoniae (ATCCBAA255)//​** ​ |  82  |  72  |  8  |  11  |  29  | |  **//​Streptococcus pneumoniae (ATCCBAA255)//​** ​ |  82  |  72  |  8  |  11  |  29  |
 |  **//​Streptococcus pneumoniae (ATCCBAA334)//​** ​ |  61  |  26  |  10  |  18  |  19  | |  **//​Streptococcus pneumoniae (ATCCBAA334)//​** ​ |  61  |  26  |  10  |  18  |  19  |
 |  **//​Synechococcus elongatus (PCC6301)//​** ​ |  4  |  2  |  1  |  2  |  2  | |  **//​Synechococcus elongatus (PCC6301)//​** ​ |  4  |  2  |  1  |  2  |  2  |
 |  **//​Vaccinia Virus//​** ​ |  21  |  11  |  2  |  3  |  11  | |  **//​Vaccinia Virus//​** ​ |  21  |  11  |  2  |  3  |  11  |
-|  **//All Organisms//​** ​ |  ​28,093  ​|  ​12,015  ​| ​ 2,572  ​| ​ 9,219  ​|  ​5,173  |+|  **//All Organisms//​** ​ |  ​31,144  ​|  ​13,719  ​| ​ 2,707  ​| ​ 9,952  ​|  ​6,597  |
  
 ===== Post Translational Modification (PTM) Statistics ===== ===== Post Translational Modification (PTM) Statistics =====
Line 264: Line 308:
 |  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  1  | |  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  1  |
 |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  | |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  |
-|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 7  |  ​ ​|  ​ ​|  ​ | +|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​3,534  ​|  ​3,534  ​| ​ 7  |  ​3,343  ​|  ​1,045  ​|  ​ | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 11  |  ​ ​|  ​ ​|  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​3,534  ​|  ​3,534  ​| ​ 11  |  ​3,343  ​|  ​1,047  ​|  ​ |
 |  **//Gallus gallus//​** ​ |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  | |  **//Gallus gallus//​** ​ |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  |
 |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  | |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  |
Line 274: Line 318:
 |  :::  |  FAT10YLATION ​ |  0  |  0  |  696  |  0  |  659  |  5  | |  :::  |  FAT10YLATION ​ |  0  |  0  |  696  |  0  |  659  |  5  |
 |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  28  |  0  |  28  |  7  | |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  28  |  0  |  28  |  7  |
-|  :::  |  NEDDYLATION ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 1,093  |  0  |  ​903  ​|  ​75  |+|  :::  |  NEDDYLATION ​ |  ​2,835  ​|  ​2,835  ​| ​ 1,093  ​| ​ 1,605  |  1,282  |  76  | 
 +|  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  49,​613 ​ |  45,​405 ​ ​| ​ 0  |  ​14,​434 ​ |  4,597  ​|  ​ |
 |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  4,392  |  0  |  2,317  |  330  | |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  4,392  |  0  |  2,317  |  330  |
-|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​705,673  ​|  ​383,699  ​| ​ 39,​038 ​ |  ​54,962  ​|  ​11,895  ​| ​ 3,118  | +|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​901,514  ​|  ​436,834  ​| ​ 39,​038 ​ |  ​62,095  ​|  ​12,523  ​| ​ 3,125  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​705,673  ​|  ​383,699  ​| ​ 45,​249 ​ |  ​54,962  ​|  ​12,022  ​| ​ 3,408  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​953,962  ​|  ​485,074  ​| ​ 45,​249 ​ |  ​63,685  ​|  ​13,034  ​| ​ 3,417  |
 |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  | |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  |
 |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  3  |  4  | |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  3  |  4  |
Line 296: Line 341:
 |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  43  |  0  |  42  |  2  | |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  43  |  0  |  42  |  2  |
 |  :::  |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  7  |  0  |  6  |  5  | |  :::  |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  7  |  0  |  6  |  5  |
-|  :::  |  SUMOYLATION ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 49  |  ​ ​|  ​41  ​|  ​39  |+|  :::  |  SUMOYLATION ​ |  ​222  ​|  ​222  ​| ​ 49  |  ​173  ​|  ​208  ​|  ​40  |
 |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  34,​482 ​ |  34,​482 ​ |  737  |  13,​810 ​ |  3,872  |  444  | |  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  34,​482 ​ |  34,​482 ​ |  737  |  13,​810 ​ |  3,872  |  444  |
 |  :::  |  UFMYLATION ​ |  0  |  0  |  10  |  0  |  10  |  1  | |  :::  |  UFMYLATION ​ |  0  |  0  |  10  |  0  |  10  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  34,482  ​| ​ 34,482  ​| ​ 847  |  13,810  ​|  ​3,901  ​|  ​484  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  34,704  ​| ​ 34,704  ​| ​ 847  |  13,929  ​|  ​4,009  ​|  ​485  |
 |  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  | |  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  NEDDYLATION ​ |  0  |  0  |  1  |  0  |  1  |  1  |
 |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  6  |  0  |  6  |  6  | |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  6  |  0  |  6  |  6  |
Line 307: Line 352:
 |  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  42,​907 ​ |  19,​981 ​ |  0  |  3,165  |  3,165  |  528  | |  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  42,​907 ​ |  19,​981 ​ |  0  |  3,165  |  3,165  |  528  |
 |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1,438  |  0  |  818  |  67  | |  :::  |  SUMOYLATION ​ |  0  |  0  |  1,438  |  0  |  818  |  67  |
-|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​34,338  ​| ​ 20,019  ​| ​ 9,736  |  2,549  ​| ​ 3,678  ​|  ​215  | +|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​35,651  ​| ​ 20,308  ​| ​ 9,736  |  2,574  ​| ​ 3,686  ​|  ​216  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​77,245  ​| ​ 40,000  ​| ​ 11,​184 ​ |  3,918  ​| ​ 4,499  ​|  ​802  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​78,558  ​| ​ 40,289  ​| ​ 11,​184 ​ |  3,928  ​| ​ 4,501  ​|  ​803  |
 |  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  4  |  3  | |  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  4  |  3  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  4  |  3  | |  :::  |  COMBINED ​ |  0  |  0  |  4  |  0  |  4  |  3  |
 +|  **//Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2//**  |  PHOSPHORYLATION ​ |  79  |  50  |  0  |  6  |  4  |  3  |
 +|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  106  |  106  |  0  |  20  |  9  |  1  |
 +|  :::  |  COMBINED ​ |  185  |  156  |  0  |  20  |  9  |  4  |
 |  **//Xenopus laevis//​** ​ |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  | |  **//Xenopus laevis//​** ​ |  UBIQUITINATION ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  0  |  0  |  2  |  0  |  2  |  2  |
Line 316: Line 364:
 |  :::  |  FAT10YLATION ​ |  0  |  0  |  696  |  0  |  659  |  5  | |  :::  |  FAT10YLATION ​ |  0  |  0  |  696  |  0  |  659  |  5  |
 |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  71  |  0  |  70  |  8  | |  :::  |  ISGYLATION ​ |  0  |  0  |  71  |  0  |  70  |  8  |
-|  :::  |  NEDDYLATION ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 1,113  |  ​ ​|  ​916  ​|  ​84  | +|  :::  |  NEDDYLATION ​ |  ​2,835  ​|  ​2,835  ​| ​ 1,113  |  ​1,605  ​|  ​1,295  ​|  ​85  | 
-|  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  ​42,907  ​|  ​19,981  ​| ​ 0  |  ​3,165  ​|  ​3,165  ​|  ​528  | +|  :::  |  PHOSPHORYLATION ​ |  ​92,599  ​|  ​65,436  ​| ​ 0  |  ​17,605  ​|  ​7,766  ​|  ​532  | 
-|  :::  |  SUMOYLATION ​ |  ​ ​|  ​ ​| ​ 5,898  |  ​ ​| ​ 3,195  ​|  ​433  | +|  :::  |  SUMOYLATION ​ |  ​222  ​|  ​222  ​| ​ 5,898  |  ​173  ​| ​ 3,362  ​|  ​434  | 
-|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​774,493  ​|  ​438,200  ​| ​ 49,​605 ​ |  ​71,321  ​|  ​19,522  ​| ​ 3,741  |+|  :::  |  UBIQUITINATION ​ |  ​975,287  ​|  ​495,264  ​| ​ 49,​605 ​ |  ​81,842  ​|  ​21,205  ​| ​ 3,750  |
 |  :::  |  UFMYLATION ​ |  0  |  0  |  10  |  0  |  10  |  1  | |  :::  |  UFMYLATION ​ |  0  |  0  |  10  |  0  |  10  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​817,400  ​|  ​458,181  ​| ​ 57,​396 ​ |  ​72,690  ​|  ​20,513  ​| ​ 4,643  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​1,070,​943 ​ ​|  ​563,757  ​| ​ 57,​396 ​ |  ​84,905  ​|  ​22,682  ​| ​ 4,656  |
  
 **Note:** Individual organism counts listed above may total to more than the values in ALL Organisms due to some interactions being counted multiple times due to cross species interactions. **Note:** Individual organism counts listed above may total to more than the values in ALL Organisms due to some interactions being counted multiple times due to cross species interactions.
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 +
 +==== 2023 Updates ==== 
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 +  * **[[Build 4.4.227]]**
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 +  * **[[Build 4.4.224]]**
 +  * **[[Build 4.4.223]]**
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 +  * **[[Build 4.4.221]]**
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 +
 +==== 2022 Updates ==== 
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