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statistics [2019/10/01 01:43]
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statistics [2019/10/31 22:36]
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   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.
   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.
-====== Current Build Statistics (3.5.177) - October ​2019 ======+====== Current Build Statistics (3.5.178) - November ​2019 ====== 
  
 ===== Physical and Genetic Interaction Statistics ===== ===== Physical and Genetic Interaction Statistics =====
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 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//​Arabidopsis thaliana (Columbia)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  55,621  ​| ​ 48,577  ​| ​ 10,418  ​| ​ 2,299  |+|  **//​Arabidopsis thaliana (Columbia)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  55,623  ​| ​ 48,579  ​| ​ 10,421  ​| ​ 2,301  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  350  |  282  |  304  |  154  | |  :::  |  GENETIC ​ |  350  |  282  |  304  |  154  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  55,971  ​| ​ 48,772  ​| ​ 10,468  ​| ​ 2,379  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  55,973  ​| ​ 48,774  ​| ​ 10,471  ​| ​ 2,381  |
 |  **//​Bacillus subtilis (168)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  3  |  2  | |  **//​Bacillus subtilis (168)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  2  |  2  |  3  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  3  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  3  |  2  |
-|  **//Bos taurus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​481  ​|  ​433  ​|  ​457  ​|  ​193  |+|  **//Bos taurus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​482  ​|  ​434  ​|  ​458  ​|  ​194  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​481  ​|  ​433  ​|  ​457  ​|  ​193  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​482  ​|  ​434  ​|  ​458  ​|  ​194  | 
-|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​22,232  ​|  ​21,583  ​|  ​5,980  ​|  ​202  |+|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​24,513  ​|  ​23,475  ​|  ​6,562  ​|  ​205  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2,338  |  2,271  |  1,133  |  35  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2,338  |  2,271  |  1,133  |  35  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​24,570  ​|  ​23,813  ​| ​ 6,404  ​|  ​220  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​26,851  ​|  ​25,703  ​| ​ 6,941  ​|  ​223  |
 |  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,450  |  1,226  |  876  |  166  | |  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,450  |  1,226  |  876  |  166  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  527  |  450  |  369  |  35  | |  :::  |  GENETIC ​ |  527  |  450  |  369  |  35  |
Line 41: Line 42:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  15  |  18  |  6  | |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  15  |  18  |  6  |
-|  **//​Cricetulus griseus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​58  ​|  ​57  ​|  ​69  ​|  ​12  |+|  **//​Cricetulus griseus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​59  ​|  ​58  ​|  ​71  ​|  ​13  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​58  ​|  ​57  ​|  ​69  ​|  ​12  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​59  ​|  ​58  ​|  ​71  ​|  ​13  |
 |  **//Danio rerio//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  248  |  210  |  207  |  42  | |  **//Danio rerio//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  248  |  210  |  207  |  42  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  | |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  |
Line 71: Line 72:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  | |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  184,​023 ​ |  181,​621 ​ |  4,063  |  7  | |  :::  |  COMBINED ​ |  184,​023 ​ |  181,​621 ​ |  4,063  |  7  |
-|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​510  ​|  ​433  ​|  ​408  ​|  ​95  |+|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​513  ​|  ​436  ​|  ​411  ​|  ​97  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  | |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​523  ​|  ​442  ​|  ​416  ​|  ​104  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​526  ​|  ​445  ​|  ​419  ​|  ​106  |
 |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
-|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​207  ​|  ​135  ​|  ​137  ​|  ​37  |+|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​210  ​|  ​136  ​|  ​138  ​|  ​38  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​207  ​|  ​135  ​|  ​137  ​|  ​37  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​210  ​|  ​136  ​|  ​138  ​|  ​38  | 
-|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​523,461  ​|  ​389,300  ​| ​ 24,024  ​| ​ 30,257  | +|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​527,486  ​|  ​392,504  ​| ​ 24,167  ​| ​ 30,442  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  7,808  ​| ​ 7,716  ​| ​ 2,678  ​|  ​335  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  7,875  ​| ​ 7,782  ​| ​ 2,727  ​|  ​339  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​531,269  ​|  ​396,364  ​| ​ 24,373  ​| ​ 30,390  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​535,361  ​|  ​399,625  ​| ​ 24,519  ​| ​ 30,576  |
 |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  265  |  204  |  173  |  48  | |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  265  |  204  |  173  |  48  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  |
Line 113: Line 114:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2,042  |  1,330  |  1,141  |  356  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2,042  |  1,330  |  1,141  |  356  |
-|  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​23  ​|  ​15  ​|  ​19  ​|  ​12  |+|  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​89  ​|  ​80  ​|  ​63  ​|  ​13  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​23  ​|  ​15  ​|  ​19  ​|  ​12  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​89  ​|  ​80  ​|  ​63  ​|  ​13  |
 |  **//Human papillomavirus (10)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//Human papillomavirus (10)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 134: Line 135:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​47,951  ​| ​ 41,532  ​| ​ 13,451  ​| ​ 4,008  |+|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​48,233  ​| ​ 41,801  ​| ​ 13,479  ​| ​ 4,027  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  382  |  337  |  341  |  194  | |  :::  |  GENETIC ​ |  382  |  337  |  341  |  194  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  48,333  ​|  ​41,794  ​| ​ 13,511  ​| ​ 4,145  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  48,615  ​|  ​42,063  ​| ​ 13,538  ​| ​ 4,164  |
 |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12  |  10  |  13  |  3  | |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12  |  10  |  13  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 164: Line 165:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  |
-|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  7,829  ​| ​ 6,653  ​| ​ 4,173  ​| ​ 1,165  |+|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  7,832  ​| ​ 6,656  ​| ​ 4,175  ​| ​ 1,167  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  7,848  ​| ​ 6,663  ​| ​ 4,183  ​| ​ 1,168  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  7,851  ​| ​ 6,666  ​| ​ 4,185  ​| ​ 1,170  |
 |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
-|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  173,640  ​| ​ 115,729  ​| ​ 6,917  ​| ​ 9,520  | +|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  173,673  ​| ​ 115,747  ​| ​ 6,920  ​| ​ 9,529  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  577,610  ​|  ​441,949  ​| ​ 5,960  |  9,244  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  577,755  ​|  ​442,049  ​| ​ 5,960  |  9,248  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  751,250  ​| ​ 544,097  ​| ​ 7,172  ​| ​ 15,761  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  751,428  ​| ​ 544,212  ​| ​ 7,175  ​| ​ 15,773  | 
-|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  17,054  ​| ​ 12,843  ​| ​ 3,558  ​| ​ 1,555  | +|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  17,162  ​| ​ 12,893  ​| ​ 3,564  ​| ​ 1,582  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  61,517  ​| ​ 51,879  ​| ​ 3,556  ​| ​ 1,912  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  61,610  ​| ​ 51,945  ​| ​ 3,562  ​| ​ 1,933  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  78,571  ​| ​ 63,640  ​| ​ 4,620  ​| ​ 2,742  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  78,772  ​| ​ 63,740  ​| ​ 4,626  ​| ​ 2,781  |
 |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  | |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
Line 194: Line 195:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  17  |  3  | |  :::  |  COMBINED ​ |  17  |  16  |  17  |  3  |
-|  **//Sus scrofa//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​84  ​|  ​80  ​|  ​96  ​|  ​29  |+|  **//Sus scrofa//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​89  ​|  ​83  ​|  ​100  ​|  ​31  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​84  ​|  ​80  ​|  ​96  ​|  ​29  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​89  ​|  ​83  ​|  ​100  ​|  ​31  |
 |  **//Tobacco Mosaic Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  3  |  1  | |  **//Tobacco Mosaic Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  3  |  2  |  3  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 209: Line 210:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,408  ​| ​ 1,246  ​| ​ 1,141  ​|  ​229  |+|  **//Xenopus laevis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,412  ​| ​ 1,248  ​| ​ 1,144  ​|  ​231  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  7  |  7  |  10  |  3  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,415  ​| ​ 1,253  ​| ​ 1,151  ​|  ​232  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,419  ​| ​ 1,255  ​| ​ 1,154  ​|  ​234  |
 |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  **//Zea mays//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
-|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​904,306  ​|  ​683,985  ​|  ​71,614  ​| ​ 49,464  | +|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​910,780  ​|  ​689,166  ​|  ​72,249  ​| ​ 49,692  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​835,837  ​| ​ 684,244  ​| ​ 21,032  ​| ​ 16,191  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​836,142  ​| ​ 684,476  ​| ​ 21,087  ​| ​ 16,220  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,740,143  ​| ​ 1,350,574  ​| ​ 76,129  ​| ​ 60,595  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,746,922  ​| ​ 1,355,957  ​| ​ 76,721  ​| ​ 60,839  |
  
 ===== Chemical Interaction Statistics ===== ===== Chemical Interaction Statistics =====
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 ====== Previous Build Statistics ====== ====== Previous Build Statistics ======
 ==== 2019 Updates ====  ==== 2019 Updates ==== 
 +  * **[[Build 3.5.178]]**
   * **[[Build 3.5.177]]**   * **[[Build 3.5.177]]**
   * **[[Build 3.5.176]]**   * **[[Build 3.5.176]]**
 
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