Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision Both sides next revision
statistics [2019/06/01 01:20]
biogridadmin
statistics [2019/06/28 02:30]
biogridadmin
Line 4: Line 4:
   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.
   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.
-====== Current Build Statistics (3.5.173) - June 2019 ======+====== Current Build Statistics (3.5.174) - July 2019 ====== 
  
  
Line 24: Line 25:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  479  |  431  |  455  |  191  | |  :::  |  COMBINED ​ |  479  |  431  |  455  |  191  |
-|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  6,362  ​| ​ 5,809  ​| ​ 3,281  ​|  ​197  | +|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  6,364  ​| ​ 5,811  ​| ​ 3,282  ​|  ​198  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  2,336  ​| ​ 2,269  ​| ​ 1,130  ​|  ​34  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  2,338  ​| ​ 2,271  ​| ​ 1,133  ​|  ​35  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  8,698  ​| ​ 8,055  ​| ​ 3,954  ​|  ​215  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  8,702  ​| ​ 8,057  ​| ​ 3,955  ​|  ​216  | 
-|  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,068  ​|  ​868  ​|  ​698  ​|  ​148  | +|  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1,080  ​|  ​876  ​|  ​705  ​|  ​152  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​483  ​|  ​408  ​|  ​329  ​|  ​31  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​521  ​|  ​444  ​|  ​363  ​|  ​32  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,551  ​| ​ 1,262  ​|  ​941  ​|  ​162  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,601  ​| ​ 1,304  ​|  ​975  ​|  ​166  |
 |  **//Canis familiaris//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  138  |  126  |  144  |  26  | |  **//Canis familiaris//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  138  |  126  |  144  |  26  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 48: Line 49:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  | |  :::  |  GENETIC ​ |  71  |  65  |  66  |  31  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  319  |  272  |  263  |  71  | |  :::  |  COMBINED ​ |  319  |  272  |  263  |  71  |
-|  **//​Dictyostelium discoideum (AX4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​24  ​|  ​17  ​|  ​20  ​|  ​ |+|  **//​Dictyostelium discoideum (AX4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​32  ​|  ​19  ​|  ​23  ​|  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  8  |  2  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  8  |  2  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​30  ​|  ​20  ​|  ​24  ​|  ​ | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​38  ​|  ​22  ​|  ​27  ​|  ​ | 
-|  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  62,​204 ​ |  52,​402 ​ |  9,001  ​| ​ 3,684  |+|  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  62,​204 ​ |  52,​402 ​ |  9,002  ​| ​ 3,684  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  14,​475 ​ |  10,​140 ​ |  3,146  |  4,394  | |  :::  |  GENETIC ​ |  14,​475 ​ |  10,​140 ​ |  3,146  |  4,394  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  76,​679 ​ |  61,​190 ​ |  9,338  ​| ​ 7,153  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  76,​679 ​ |  61,​190 ​ |  9,339  ​| ​ 7,153  |
 |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  | |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  |
Line 66: Line 67:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  9  |  9  |  10  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  9  |  9  |  10  |  2  |
-|  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​114  ​|  ​110  ​|  ​118  ​|  ​24  |+|  **//​Escherichia coli (K12/​MG1655)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​2,299  ​|  ​2,117  ​|  ​1,303  ​|  ​26  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  26  |  25  |  36  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  26  |  25  |  36  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​140  ​|  ​134  ​|  ​152  ​|  ​36  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​2,325  ​|  ​2,141  ​|  ​1,334  ​|  ​38  |
 |  **//​Escherichia coli (K12/​W3110)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12,​804 ​ |  12,​801 ​ |  2,045  |  3  | |  **//​Escherichia coli (K12/​W3110)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12,​804 ​ |  12,​801 ​ |  2,045  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  | |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  |
Line 78: Line 79:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  :::  |  COMBINED ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
-|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​197  ​| ​ 133  |  135  |  ​34  |+|  **//​Hepatitus C Virus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​200  ​| ​ 133  |  135  |  ​35  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​197  ​| ​ 133  |  135  |  ​34  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​200  ​| ​ 133  |  135  |  ​35  | 
-|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​500,247  ​|  ​371,513  ​| ​ 23,795  ​| ​ 29,471  | +|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​512,912  ​|  ​381,958  ​| ​ 23,929  ​| ​ 29,695  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  7,666  ​| ​ 7,574  ​| ​ 2,560  ​|  ​333  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  7,807  ​| ​ 7,715  ​| ​ 2,677  ​|  ​334  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​507,913  ​|  ​378,455  ​| ​ 24,139  ​| ​ 29,603  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​520,719  ​|  ​389,038  ​| ​ 24,280  ​| ​ 29,828  |
 |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  265  |  204  |  173  |  48  | |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  265  |  204  |  173  |  48  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  |
Line 111: Line 112:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  777  |  692  |  715  |  41  | |  :::  |  COMBINED ​ |  777  |  692  |  715  |  41  |
-|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,003  ​| ​ 1,316  ​| ​ 1,128  ​|  ​349  |+|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  2,026  ​| ​ 1,325  ​| ​ 1,137  ​|  ​352  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  2,004  ​| ​ 1,316  ​| ​ 1,128  ​|  ​350  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  2,027  ​| ​ 1,325  ​| ​ 1,137  ​|  ​353  | 
-|  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​20  ​|  ​12  ​|  ​16  ​|  ​11  |+|  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  ​23  ​|  ​15  ​|  ​19  ​|  ​12  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​20  ​|  ​12  ​|  ​16  ​|  ​11  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​23  ​|  ​15  ​|  ​19  ​|  ​12  |
 |  **//Human papillomavirus (10)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  **//Human papillomavirus (10)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  **//Human papillomavirus (16)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​244  ​|  ​181  ​|  ​168  ​|  ​21  |+|  **//Human papillomavirus (16)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​253  ​|  ​185  ​|  ​172  ​|  ​24  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​244  ​|  ​181  ​|  ​168  ​|  ​21  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​253  ​|  ​185  ​|  ​172  ​|  ​24  |
 |  **//Human papillomavirus (6b)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  20  |  20  |  22  |  2  | |  **//Human papillomavirus (6b)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  20  |  20  |  22  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 132: Line 133:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​46,968  ​| ​ 40,654  ​| ​ 13,296  ​| ​ 3,942  | +|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​47,053  ​| ​ 40,702  ​| ​ 13,306  ​| ​ 3,968  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​378  ​|  ​333  ​|  ​337  ​|  ​193  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​382  ​|  ​337  ​|  ​341  ​|  ​194  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  47,346  ​| ​ 40,914  ​| ​ 13,355  ​| ​ 4,078  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  47,435  ​| ​ 40,964  ​| ​ 13,366  ​| ​ 4,105  |
 |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12  |  10  |  13  |  3  | |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  12  |  10  |  13  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 144: Line 145:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  3  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//​Oryctolagus cuniculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​314  ​|  ​281  ​|  ​287  ​|  ​63  |+|  **//​Oryctolagus cuniculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​316  ​|  ​282  ​|  ​289  ​|  ​65  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​314  ​|  ​281  ​|  ​287  ​|  ​63  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​316  ​|  ​282  ​|  ​289  ​|  ​65  |
 |  **//Oryza sativa (Japonica)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  343  |  327  |  310  |  20  | |  **//Oryza sativa (Japonica)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  343  |  327  |  310  |  20  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
Line 162: Line 163:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  |
-|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  7,766  ​| ​ 6,616  ​| ​ 4,152  ​| ​ 1,153  |+|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  7,779  ​| ​ 6,628  ​| ​ 4,159  ​| ​ 1,158  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  7,785  ​| ​ 6,626  ​| ​ 4,162  ​| ​ 1,156  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  7,798  ​| ​ 6,638  ​| ​ 4,169  ​| ​ 1,161  |
 |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
-|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  171,528  ​| ​ 114,426  ​| ​ 6,907  ​| ​ 9,409  | +|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  171,959  ​| ​ 114,693  ​| ​ 6,909  ​| ​ 9,422  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​575,931  ​|  ​440,948  ​| ​ 5,957  ​| ​ 9,136  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​576,131  ​|  ​441,069  ​| ​ 5,958  ​| ​ 9,156  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​747,459  ​| ​ 542,068  ​| ​ 7,164  ​| ​ 15,586  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  ​748,090  ​| ​ 542,419  ​| ​ 7,165  ​| ​ 15,613  | 
-|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  15,275  ​| ​ 11,199  ​| ​ 3,278  ​| ​ 1,517  | +|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  15,294  ​| ​ 11,210  ​| ​ 3,279  ​| ​ 1,520  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  60,558  ​| ​ 51,028  ​| ​ 3,477  ​| ​ 1,864  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  60,572  ​| ​ 51,034  ​| ​ 3,479  ​| ​ 1,871  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  75,833  ​| ​ 61,247  ​| ​ 4,468  ​| ​ 2,673  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  75,866  ​| ​ 61,263  ​| ​ 4,469  ​| ​ 2,681  |
 |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  | |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
Line 180: Line 181:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  34  |  16  |  19  |  16  | |  :::  |  COMBINED ​ |  34  |  16  |  19  |  16  |
-|  **//Simian Virus 40//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​10  ​| ​ 5  |  6  |  ​ |+|  **//Simian Virus 40//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​11  ​| ​ 5  |  6  |  ​ |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​10  ​| ​ 5  |  6  |  ​ |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​11  ​| ​ 5  |  6  |  ​ |
 |  **//Solanum lycopersicum//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  137  |  107  |  44  |  8  | |  **//Solanum lycopersicum//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  137  |  107  |  44  |  8  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  4  |  4  |  4  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  4  |  4  |  4  |  1  |
Line 213: Line 214:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
-|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​857,894  ​|  ​644,337  ​|  ​66,932  ​| ​ 48,489  | +|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​873,288  ​|  ​657,116  ​|  ​68,258  ​| ​ 48,746  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  833,007  ​| ​ 682,202  ​| ​ 20,785  ​| ​ 16,028  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  833,406  ​| ​ 682,512  ​| ​ 20,946  ​| ​ 16,059  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,690,901  ​| ​ 1,309,311  ​|  ​71,802  ​| ​ 59,525  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,706,694  ​| ​ 1,322,353  ​|  ​73,159  ​| ​ 59,803  |
  
 ===== Chemical Interaction Statistics ===== ===== Chemical Interaction Statistics =====
Line 324: Line 325:
 ====== Previous Build Statistics ====== ====== Previous Build Statistics ======
 ==== 2019 Updates ====  ==== 2019 Updates ==== 
 +  * **[[Build 3.5.174]]**
   * **[[Build 3.5.173]]**   * **[[Build 3.5.173]]**
   * **[[Build 3.5.172]]**   * **[[Build 3.5.172]]**
 
statistics.txt · Last modified: 2024/03/01 01:06 by biogridadmin