Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision Both sides next revision
statistics [2019/01/01 01:04]
biogridadmin
statistics [2019/02/01 00:27]
biogridadmin
Line 4: Line 4:
   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.   * **Raw Interactions** -  Each unique combination of interactors A and B, experimental system and publication is counted as a single interaction. Reciprocal interactions (A → B and B → A) are counted twice.
   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.   * **Non-Redundant Interactions** - Each unique combination of interactors A and B are counted as a single interaction,​ regardless of directionality, ​ experimental system and publication.
-====== Current Build Statistics (3.5.168) - January ​2019 ======+====== Current Build Statistics (3.5.169) - February ​2019 ======
  
 ===== Physical and Genetic Interaction Statistics ===== ===== Physical and Genetic Interaction Statistics =====
Line 23: Line 23:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  459  |  417  |  446  |  189  | |  :::  |  COMBINED ​ |  459  |  417  |  446  |  189  |
-|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  6,352  ​| ​ 5,806  ​| ​ 3,280  ​|  ​194  |+|  **//​Caenorhabditis elegans//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  6,354  ​| ​ 5,807  ​| ​ 3,281  ​|  ​195  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2,336  |  2,269  |  1,130  |  34  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2,336  |  2,269  |  1,130  |  34  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  8,688  ​| ​ 8,052  ​| ​ 3,953  ​|  ​212  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  8,690  ​| ​ 8,053  ​| ​ 3,954  ​|  ​213  | 
-|  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​927  ​|  ​731  ​|  ​583  ​|  ​140  |+|  **//Candida albicans (SC5314)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​929  ​|  ​733  ​|  ​584  ​|  ​142  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  306  |  293  |  303  |  28  | |  :::  |  GENETIC ​ |  306  |  293  |  303  |  28  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,233  ​| ​ 1,011  ​|  ​808  ​|  ​152  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,235  ​| ​ 1,013  ​|  ​809  ​|  ​154  |
 |  **//Canis familiaris//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  35  |  53  |  24  | |  **//Canis familiaris//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  35  |  53  |  24  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 51: Line 51:
 |  :::  |  COMBINED ​ |  30  |  20  |  24  |  8  | |  :::  |  COMBINED ​ |  30  |  20  |  24  |  8  |
 |  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  62,​181 ​ |  52,​375 ​ |  9,001  |  3,687  | |  **//​Drosophila melanogaster//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  62,​181 ​ |  52,​375 ​ |  9,001  |  3,687  |
-|  :::  |  GENETIC ​ |  14,476  ​| ​ 10,139  ​| ​ 3,145  ​| ​ 4,394  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  14,477  ​| ​ 10,140  ​| ​ 3,146  ​| ​ 4,395  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  76,657  ​| ​ 61,162  ​| ​ 9,338  |  7,156  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  76,658  ​| ​ 61,163  ​| ​ 9,338  |  7,157  |
 |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  | |  **//​Emericella nidulans (FGSC A4)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  65  |  57  |  57  |  3  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  5  |  7  |  3  |
Line 71: Line 71:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  | |  :::  |  GENETIC ​ |  171,​219 ​ |  169,​594 ​ |  3,973  |  4  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  184,​023 ​ |  181,​621 ​ |  4,063  |  7  | |  :::  |  COMBINED ​ |  184,​023 ​ |  181,​621 ​ |  4,063  |  7  |
-|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​488  ​|  ​416  ​|  ​388  ​|  ​86  |+|  **//Gallus gallus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​496  ​|  ​422  ​|  ​396  ​|  ​89  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  | |  :::  |  GENETIC ​ |  13  |  10  |  15  |  10  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​501  ​|  ​425  ​|  ​396  ​|  ​95  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​509  ​|  ​431  ​|  ​404  ​|  ​98  |
 |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  | |  **//Glycine max//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  46  |  40  |  45  |  8  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 80: Line 80:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  192  |  131  |  133  |  33  | |  :::  |  COMBINED ​ |  192  |  131  |  133  |  33  |
-|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​481,059  ​|  ​356,717  ​|  ​22,987  ​| ​ 28,528  | +|  **//Homo sapiens//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​486,009  ​|  ​360,538  ​|  ​23,070  ​| ​ 28,755  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  5,295  ​| ​ 5,214  ​| ​ 2,192  ​|  ​325  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  5,299  ​| ​ 5,218  ​| ​ 2,196  ​|  ​327  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​486,354  ​|  ​361,468  ​| ​ 23,291  ​| ​ 28,654  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​491,308  ​|  ​365,293  ​| ​ 23,373  ​| ​ 28,883  |
 |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  253  |  192  |  171  |  47  | |  **//Human Herpesvirus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  253  |  192  |  171  |  47  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  6  |  6  |  7  |  1  |
Line 92: Line 92:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  4  |  2  |  4  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  4  |  2  |  4  |  2  |
-|  **//Human Herpesvirus 4//**  |  PHYSICAL ​ |  ​396  ​|  ​303  ​|  ​302  ​|  ​43  |+|  **//Human Herpesvirus 4//**  |  PHYSICAL ​ |  ​402  ​|  ​305  ​|  ​304  ​|  ​44  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  ​396  ​|  ​303  ​|  ​302  ​|  ​43  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  ​402  ​|  ​305  ​|  ​304  ​|  ​44  |
 |  **//Human Herpesvirus 5//**  |  PHYSICAL ​ |  116  |  81  |  93  |  23  | |  **//Human Herpesvirus 5//**  |  PHYSICAL ​ |  116  |  81  |  93  |  23  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 110: Line 110:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  770  |  690  |  715  |  40  | |  :::  |  COMBINED ​ |  770  |  690  |  715  |  40  |
-|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  1,981  ​| ​ 1,311  ​| ​ 1,123  ​|  ​343  |+|  **//Human Immunodeficiency Virus 1//**  |  PHYSICAL ​ |  1,988  ​| ​ 1,312  ​| ​ 1,124  ​|  ​344  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  1  |  1  |  2  |  1  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,982  ​| ​ 1,311  ​| ​ 1,123  ​|  ​344  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,989  ​| ​ 1,312  ​| ​ 1,124  ​|  ​345  |
 |  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  20  |  12  |  16  |  11  | |  **//Human Immunodeficiency Virus 2//**  |  PHYSICAL ​ |  20  |  12  |  16  |  11  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 131: Line 131:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2  |  2  |  2  |  1  |
-|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  45,465  ​| ​ 39,357  ​| ​ 13,122  ​| ​ 3,830  | +|  **//Mus musculus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  45,589  ​| ​ 39,426  ​| ​ 13,140  ​| ​ 3,857  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  ​377  ​|  ​332  ​|  ​336  ​|  ​192  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  ​378  ​|  ​333  ​|  ​337  ​|  ​193  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  45,842  ​| ​ 39,616  ​| ​ 13,181  ​| ​ 3,965  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  45,967  ​| ​ 39,686  ​| ​ 13,199  ​| ​ 3,993  |
 |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  11  |  9  |  11  |  2  | |  **//​Mycobacterium tuberculosis (H37Rv)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  11  |  9  |  11  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
Line 161: Line 161:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  | |  :::  |  COMBINED ​ |  2,545  |  2,508  |  1,227  |  5  |
-|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  6,879  ​| ​ 5,819  ​| ​ 3,852  ​| ​ 1,108  |+|  **//Rattus norvegicus//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  6,949  ​| ​ 5,865  ​| ​ 3,870  ​| ​ 1,126  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  | |  :::  |  GENETIC ​ |  19  |  19  |  31  |  12  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  6,898  ​| ​ 5,829  ​| ​ 3,862  ​| ​ 1,111  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  6,968  ​| ​ 5,875  ​| ​ 3,880  ​| ​ 1,129  |
 |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  **//Ricinus communis//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  | |  :::  |  COMBINED ​ |  5  |  2  |  3  |  2  |
-|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  167,221  ​| ​ 111,399  ​| ​ 6,901  ​| ​ 9,198  | +|  **//​Saccharomyces cerevisiae (S288c)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  167,453  ​| ​ 111,458  ​| ​ 6,902  ​| ​ 9,231  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  573,266  ​| ​ 439,428  ​| ​ 5,957  |  8,962  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  573,370  ​| ​ 439,469  ​| ​ 5,957  |  8,984  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  740,487  ​| ​ 537,840  ​| ​ 7,160  ​| ​ 15,280  | +|  :::  |  COMBINED ​ |  740,823  ​| ​ 537,912  ​| ​ 7,161  ​| ​ 15,326  | 
-|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​14,181  ​| ​ 10,326  ​| ​ 3,097  ​| ​ 1,452  |+|  **//​Schizosaccharomyces pombe (972h)//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​13,927  ​| ​ 10,074  ​| ​ 3,080  ​| ​ 1,456  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  60,​108 ​ |  50,​669 ​ |  3,429  |  1,787  | |  :::  |  GENETIC ​ |  60,​108 ​ |  50,​669 ​ |  3,429  |  1,787  |
-|  :::  |  COMBINED ​ |  74,289  ​|  ​60,046  ​| ​ 4,378  ​| ​ 2,560  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  74,035  ​|  ​59,796  ​| ​ 4,373  ​| ​ 2,564  |
 |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  | |  **//​Selaginella moellendorffii//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  8  |  6  |  5  |  1  |
 |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  | |  :::  |  GENETIC ​ |  2  |  2  |  3  |  1  |
Line 212: Line 212:
 |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  | |  :::  |  GENETIC ​ |  0  |  0  |  0  |  0  |
 |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  | |  :::  |  COMBINED ​ |  18  |  13  |  21  |  9  |
-|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​831,461  ​|  ​624,056  ​| ​ 65,829  ​| ​ 47,216  | +|  **//All Organisms//​** ​ |  PHYSICAL ​ |  ​836,570  ​|  ​627,790  ​| ​ 65,925  ​| ​ 47,499  | 
-|  :::  |  GENETIC ​ |  827,347  ​| ​ 677,846  ​| ​ 20,342  ​| ​ 15,768  | +|  :::  |  GENETIC ​ |  827,456  ​| ​ 677,892  ​| ​ 20,346  ​| ​ 15,793  | 
-|  :::  |  COMBINED ​ |  1,658,808  ​| ​ 1,285,194  ​| ​ 70,736  ​| ​ 58,106  |+|  :::  |  COMBINED ​ |  1,664,026  ​| ​ 1,288,948  ​| ​ 70,842  ​| ​ 58,405  |
  
 ===== Chemical Interaction Statistics ===== ===== Chemical Interaction Statistics =====
Line 323: Line 323:
 ====== Previous Build Statistics ====== ====== Previous Build Statistics ======
 ==== 2019 Updates ====  ==== 2019 Updates ==== 
 +  * **[[Build 3.5.169]]**
   * **[[Build 3.5.168]]**   * **[[Build 3.5.168]]**
  
 
statistics.txt · Last modified: 2024/04/01 00:50 by biogridadmin